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Enregistrement W1987293272 · doi:10.1074/jbc.m804293200

Linkage between Phosphorylation of the Origin Recognition Complex and Its ATP Binding Activity in Saccharomyces cerevisiae

2008· article· en· W1987293272 sur OpenAlexfundno aff
Masaki Makise, Masaya Takehara, Akihiko Kuniyasu, Nanako Matsui, Hitoshi Nakayama, Tohru Mizushima

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueDNA Repair Mechanisms
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesInstitute of GeneticsJapan Society for the Promotion of ScienceUniversity of California, San Francisco
Mots-clésOrigin recognition complexSaccharomyces cerevisiaeBiologyCyclin-dependent kinasePhosphorylationCell cycleCell biologyDNA replicationBiochemistryLicensing factorDephosphorylationOrigin of replicationEukaryotic DNA replicationDNACellYeastPhosphatase

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The initiation of chromosomal DNA replication is tightly regulated to achieve genome replication just once per cell cycle and cyclin-dependent kinase (CDK) plays an important role in this process. Adenine nucleotides that bind to the origin recognition complex (ORC) are also suggested to be involved in this process. Of the six subunits of the Saccharomyces cerevisiae ORC (Orc1-6p), both Orc1p and Orc5p have ATP binding activity, and both Orc2p and Orc6p are phosphorylated by CDK in cells. In this study we constructed a series of yeast strains expressing phospho-mimetic mutants of Orc2p or Orc6p and found that expression of a Ser-188 mutant of Orc2p (Orc2-5Dp) delays G1-S transition and S phase progression and causes the accumulation of cells with 2C DNA content. Using antibody that specifically recognizes Ser-188-phosphorylated Orc2p, we showed that Ser-188 is phosphorylated by CDK in a cell cycle-regulated manner. Expression of Orc2-5Dp caused phosphorylation of Rad53p and inefficient loading of the six minichromosome maintenance proteins. These results suggest that the accumulation of cells with 2C DNA content is due to inefficient origin firing and induction of the cell cycle checkpoint response and that dephosphorylation of Ser-188 of Orc2p in late M or G1 phase may be involved in pre-RC formation. In vitro, a purified mutant ORC containing Orc2-5Dp lost Orc5p ATP binding activity. This is the first demonstration of a link between phosphorylation of the ORC and its ability to bind ATP, which may be important for the cell cycle-regulated initiation of DNA replication.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,007

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,069
Tête enseignante GPT0,280
Écart entre enseignants0,212 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations17
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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