Single nucleotide polymorphisms refine QTL intervals for hip joint laxity in dogs
Notice bibliographique
Résumé
Hip laxity is one characteristic of canine hip dysplasia (CHD), an inheritable disease that leads to hip osteoarthritis. Using a genome-wide screen with 250 microsatellites in a crossbreed pedigree of 159 dysplastic Labrador retrievers and unaffected greyhounds, we previously identified putative (P < 0.01) QTL on canine chromosomes 11 and 29 (CFA11 and CFA29). To refine these QTL locations, we have genotyped 257 dogs including 105 Labrador retrievers, seven greyhounds, four generations of their crossbreed offspring and three German shepherds for 111 and 171 SNPs on CFA11 and CFA29 respectively. The distraction index (DI, a measure of maximum hip laxity) was used as an intermediate phenotype that predicts whether a hip joint will or will not develop osteoarthritis. Using a multipoint linkage analysis, significant evidence (95% posterior probability) was found for QTL contributing to hip laxity in the 16.2-21 cM region on CFA11 that explained 15-18% of the total variance in DI. Evidence for an independent QTL on CFA29 was weaker than that on CFA11. Identification of the causative mutation(s) will lead to better understanding of biochemical pathways in both dogs and humans with hip laxity and dysplasia.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».