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Enregistrement W1987513027 · doi:10.1109/tbcas.2014.2308993

Guest Editorial—Special Issue on '-Omics' Based Companion Diagnostics for Personalized Medicine

2014· editorial· en· W1987513027 sur OpenAlexaff
Jie Chen, Shankar Subramaniam, David S. Wishart, Stephen T.C. Wong

Notice bibliographique

RevueIEEE Transactions on Biomedical Circuits and Systems · 2014
Typeeditorial
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics, Bioinformatics, and Biomedical Research
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSystems biologyOmicsPersonalized medicineSystems medicineData scienceComputer scienceGenomicsPrecision medicineProteomicsComputational biologyBioinformaticsMedicineBiologyGenome

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Companion diagnostics are essential to the success of personalized medicine. With the rapid advances made in high throughput molecular biology, such as genomics, proteomics, and metabolomics, in the past two decades, scientists, researchers and engineers are beginning to harvest the power of '-omics' to develop companion diagnostic circuits and systems. These systems can be used to diagnose, monitor or predict not just a single disease, but multiple diseases simultaneously. This allows for the management of disease at a personal level, i.e., accordingly to the biology, needs and lifestyle of individual patients. Foreseeing this emerging trend, we are pleased to present this special issue to: (i) provide a road map of '-omics' networks, circuits and systems; (ii) encourage cross-disciplinary collaboration in this emerging research field; and (iii) report the cutting edge development of these circuits and devices with potential for translation into the clinic. A number of submissions were received, covering a wide range of circuits and systems related '-omics' topics, such as (i) DNA, RNA, protein, and small molecule sensors for companion diagnostics; (ii) micro/nanofluidics technologies related to '-omics'; and (iii) circuit based modeling and simulation of '-omics' systems including gene regulatory and signaling networks. After rigorous peer review nine papers were finally selected in this special issue. The papers can be broadly divided into three groups and briefly introduced below.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,002
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesMéta-épidémiologie (sens strict), Intégrité de la recherche
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: Sans objet
GenreSignal candidat: Éditorial · Signal consensuel: Éditorial
Score de désaccord entre enseignants0,074
Score d'incertitude au seuil1,000

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0020,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0030,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,020
Tête enseignante GPT0,292
Écart entre enseignants0,273 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreÉditorial

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations1
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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