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Enregistrement W1987672422 · doi:10.1104/pp.114.239400

SALT-OVERLY SENSITIVE5 Mediates Arabidopsis Seed Coat Mucilage Adherence and Organization through Pectins  

2014· article· en· W1987672422 sur OpenAlexafffund
Jonathan S. Griffiths, Allen Yi‐Lun Tsai, Hui Xue, Cătălin Voiniciuc, Georg J. Seifert, Shawn D. Mansfield, George W. Haughn

Notice bibliographique

RevuePLANT PHYSIOLOGY · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePolysaccharides and Plant Cell Walls
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesUniversity of British Columbia
Mots-clésMucilageCelluloseCell wallXyloglucanPectinArabidopsisPolysaccharideArabidopsis thalianaMutantAdhesionSecondary cell wallChemistryBiochemistryBiophysicsBotanyBiologyOrganic chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Interactions between cell wall polymers are critical for establishing cell wall integrity and cell-cell adhesion. Here, we exploit the Arabidopsis (Arabidopsis thaliana) seed coat mucilage system to examine cell wall polymer interactions. On hydration, seeds release an adherent mucilage layer strongly attached to the seed in addition to a nonadherent layer that can be removed by gentle agitation. Rhamnogalacturonan I (RG I) is the primary component of adherent mucilage, with homogalacturonan, cellulose, and xyloglucan constituting minor components. Adherent mucilage contains rays composed of cellulose and pectin that extend above the center of each epidermal cell. CELLULOSE SYNTHASE5 (CESA5) and the arabinogalactan protein SALT-OVERLY SENSITIVE5 (SOS5) are required for mucilage adherence through unknown mechanisms. SOS5 has been suggested to mediate adherence by influencing cellulose biosynthesis. We, therefore, investigated the relationship between SOS5 and CESA5. cesa5-1 seeds show reduced cellulose, RG I, and ray size in adherent mucilage. In contrast, sos5-2 seeds have wild-type levels of cellulose but completely lack adherent RG I and rays. Thus, relative to each other, cesa5-1 has a greater effect on cellulose, whereas sos5-2 mainly affects pectin. The double mutant cesa5-1 sos5-2 has a much more severe loss of mucilage adherence, suggesting that SOS5 and CESA5 function independently. Double-mutant analyses with mutations in MUCILAGE MODIFIED2 and FLYING SAUCER1 that reduce mucilage release through pectin modification suggest that only SOS5 influences pectin-mediated adherence. Together, these findings suggest that SOS5 mediates adherence through pectins and does so independently of but in concert with cellulose synthesized by CESA5.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,189
Écart entre enseignants0,177 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations97
Publié2014
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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