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Enregistrement W1987708761 · doi:10.1074/jbc.c200381200

The Drosophila melanogaster brainiac Protein Is a Glycolipid-specific β1,3N-Acetylglucosaminyltransferase

2002· article· en· W1987708761 sur OpenAlexaboutno aff
Reto Mu ̈ller, Friedrich Altmann, Dapeng Zhou, Thierry Hennet

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2002
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGlycosylation and Glycoproteins Research
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesSchweizerischer Nationalfonds zur Förderung der Wissenschaftlichen ForschungNational Science Foundation
Mots-clésBiologyGeneGlycolipidDrosophila melanogasterGlycosylationMolecular biologyLocus (genetics)Biochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations at the Drosophila melanogaster brainiac locus lead to defective formation of the follicular epithelium during oogenesis and to neural hyperplasia. The brainiac gene encodes a type II transmembrane protein structurally similar to mammalian beta1,3-glycosyltransferases. We have cloned the brainiac gene from D. melanogaster genomic DNA and expressed it as a FLAG-tagged recombinant protein in Sf9 insect cells. Glycosyltransferase assays showed that brainiac is capable of transferring N-acetylglucosamine (GlcNAc) to beta-linked mannose (Man), with a marked preference for the disaccharide Man(beta1,4)Glc, the core of arthro-series glycolipids. The activity of brainiac toward arthro-series glycolipids was confirmed by showing that the enzyme efficiently utilized glycolipids from insects as acceptors whereas it did not with glycolipids from mammalian cells. Methylation analysis of the brainiac reaction product revealed a beta1,3 linkage between GlcNAc and Man, proving that brainiac is a beta1,3GlcNAc-transferase. Human beta1,3GlcNAc-transferases structurally related to brainiac were unable to transfer GlcNAc to Man(beta1,4)Glc-based acceptor substrates and failed to rescue a homozygous lethal brainiac allele, indicating that these proteins are paralogous and not orthologous to brainiac.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,033
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,226 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations54
Publié2002
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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