MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1987829622 · doi:10.4161/chan.4.1.10364

Long C terminal splice variant Ca<sub>V</sub>2.2 identified in presynaptic membrane by mass spectrometric analysis

2010· article· en· W1987829622 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.
fundUn bailleur canadien est enregistré sur le travail.

Notice bibliographique

RevueChannels · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensSynaptive (Canada)
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchCanada Research Chairs
Mots-clésSynaptosomeChemistryLysisImmunoprecipitationMembraneGatingBiochemistryMembrane proteinChromatographyBiophysicsBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Ca(V)2.2 voltage-gated calcium channels play a key role in the gating of transmitter release at presynaptic terminals. Recently we used mass spectrometry (MS) to analyze the protein complex associated with Ca(V)2.2 in purified presynaptic terminal membranes. A number of known and new Ca(V)2.2-associated proteins were identified, but not the channel itself. Here we set out to explore this anomaly. As previously, we used antibody Ab571 to capture the channel from purified synaptosome membrane lysate. We prepared a brain membrane lysate enriched for presynaptic active zones using standard methods to fractionate purified synaptosomes. These were osmotically lysed to generate a fraction enriched in presynaptic surface membranes. The lysate was solubilized in modified RIPA buffer and was passed over anti-Ca(V)2.2 antibody covalently bonded to immunoprecipitation beads. Captured complexes on the beads were then stripped of weakly-bound proteins by exposure to high salt to enrich the channel fraction. Proteins remaining bound to the sample were recovered in high concentration urea and the sample was subjected to standard enzyme digestion and MS analysis. We identified 12 distinct Ca(V)2.2 peptides, but no other ion channel peptides, in the lysate-exposed bead sample but no other ion channel peptides were recovered. Interestingly one of the channel peptides was derived from the alternatively spliced, long-C terminal region. Hence, confidence in identification of Ca(V)2.2 was beyond reasonable doubt. The identification of the long-splice Ca(V)2.2 provides compelling evidence that this variant is targeted to the presynaptic terminal, as we and others have suggested.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,018
Score d'incertitude au seuil0,788

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle