Long C terminal splice variant Ca<sub>V</sub>2.2 identified in presynaptic membrane by mass spectrometric analysis
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Ca(V)2.2 voltage-gated calcium channels play a key role in the gating of transmitter release at presynaptic terminals. Recently we used mass spectrometry (MS) to analyze the protein complex associated with Ca(V)2.2 in purified presynaptic terminal membranes. A number of known and new Ca(V)2.2-associated proteins were identified, but not the channel itself. Here we set out to explore this anomaly. As previously, we used antibody Ab571 to capture the channel from purified synaptosome membrane lysate. We prepared a brain membrane lysate enriched for presynaptic active zones using standard methods to fractionate purified synaptosomes. These were osmotically lysed to generate a fraction enriched in presynaptic surface membranes. The lysate was solubilized in modified RIPA buffer and was passed over anti-Ca(V)2.2 antibody covalently bonded to immunoprecipitation beads. Captured complexes on the beads were then stripped of weakly-bound proteins by exposure to high salt to enrich the channel fraction. Proteins remaining bound to the sample were recovered in high concentration urea and the sample was subjected to standard enzyme digestion and MS analysis. We identified 12 distinct Ca(V)2.2 peptides, but no other ion channel peptides, in the lysate-exposed bead sample but no other ion channel peptides were recovered. Interestingly one of the channel peptides was derived from the alternatively spliced, long-C terminal region. Hence, confidence in identification of Ca(V)2.2 was beyond reasonable doubt. The identification of the long-splice Ca(V)2.2 provides compelling evidence that this variant is targeted to the presynaptic terminal, as we and others have suggested.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle