Analyses of the tumour suppressor ING1 expression and gene mutation in human basal cell carcinoma
Notice bibliographique
Résumé
The incidence of basal cell carcinoma is the highest among all human malignancies. Epidemiological evidence indicates that ultraviolet radiation is the primary environmental cause for the pathogenesis of basal cell carcinoma. However, the genetic changes caused by ultraviolet radiation that lead to basal cell carcinoma formation remain unclear. We and others have demonstrated that the ING1 (inhibitor of growth 1) tumour suppressor plays an important role in cellular stress response to ultraviolet irradiation, such as DNA repair and apoptosis. This study was designed to investigate whether ING1 is overexpressed and/or mutated in human basal cell carcinoma. Immunohistochemistry, single-strand conformation polymorphism, and DNA sequencing were used to determine the expression and mutational status of the ING1 gene in 54 basal cell carcinoma biopsies. Immunohistochemical staining demonstrated that ING1 is overexpressed in 25% (6/24) human basal cell carcinomas. Single-strand conformation polymorphism and DNA sequencing revealed that only 1 in 54 (1.8%) basal cell carcinoma primaries contained a missense mutation in the ING1 gene. The mutation is located in exon 2 and could thus potentially interfere with the structure of every ING1 isoforms and the functions of the PHD zinc finger motif. Our data indicate that overexpression and mutation of the ING1 gene are infrequent in human basal cell carcinoma.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».