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Enregistrement W1987885869 · doi:10.1186/1756-0500-6-387

Polymorphisms of the cytokine genes TGFB1 and IL10 in a mixed-race population with Crohn’s disease

2013· article· en· W1987885869 sur OpenAlexaboutno aff
Neogélia Almeida, Genoile Oliveira Santana, Tamara Celi Almeida, Maria Teresita Bendicho, Denise Carneiro Lemaire, Maurício Cardeal, André Castro Lyra

Notice bibliographique

RevueBMC Research Notes · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueInflammatory Bowel Disease
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésSingle-nucleotide polymorphismAlleleGeneticsLinkage disequilibriumGenotypeHaplotypeAllele frequencyInterleukin 10Odds ratioBiologyGeneGenetic associationMedicineInternal medicineCytokine

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Most Crohn's disease (CD) genes discovered in recent years are associated with biological systems critical to the development of this disease. TGFB1 and IL10 are cytokines with important roles in CD. The aim of this study was to evaluate the association between CD, its clinical features and TGFB1 and IL10 gene polymorphisms. METHODS: This case-control study enrolled 91 patients and 91 controls from the state of Bahia, Brazil. Five single nucleotide polymorphisms (SNPs) were studied in the TGFB1 gene (codon 10 T > C--rs1800470; codon 25 G > C--rs1800471) and IL10 gene (-1082 A > G--rs1800896; -819 T > C--rs1800871; -592 A > C--rs1800872). An analysis of the genetic polymorphisms was performed using a commercial kit. A comparison of allele frequencies and genotypes was estimated by calculating the odds ratio (OR) with a confidence interval adjusted via the Bonferroni test for a local alpha of 1%. A stratified analysis was applied for gender, race and smoking history. Patients with CD were characterized according to the Montreal classification. RESULTS: The C allele and CC genotype of the TGFB1 gene rs1800470 were both significantly associated with CD. The stratified analysis showed no confounding factors for the co-variables of gender, race and smoking history. The IL10 gene rs1800896 G allele was significantly associated with age at diagnosis of CD, while the T allele of the IL10 gene rs1800871 was significantly associated with perianal disease. The SNPs rs1800871 and rs1800872 were in 100% linkage disequilibrium. CONCLUSIONS: TGFB1 gene polymorphisms may be associated with susceptibility to the development of CD, and IL10 gene polymorphisms appear to influence the CD phenotype in this admixed population.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,083
Score d'incertitude au seuil0,264

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,301
Écart entre enseignants0,271 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations7
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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