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Enregistrement W1987929386 · doi:10.1021/bi0504005

Structural Characterization of the Antimicrobial Peptide Pleurocidin from Winter Flounder

2005· article· en· W1987929386 sur OpenAlexaff
Raymond T. Syvitski, Ian W. Burton, Neil R. Mattatall, Susan E. Douglas, David L. Jakeman

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensInstitute for Marine BiosciencesDalhousie University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésMicelleRandom coilPeptideChemistryWinter flounderAntimicrobial peptidesAqueous solutionMembraneMucusAntimicrobialFlounderTwo-dimensional nuclear magnetic resonance spectroscopyCrystallographyBiophysicsStereochemistryCircular dichroismBiochemistryOrganic chemistryBiologyFish <Actinopterygii>

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Pleurocidin is an antimicrobial peptide that was isolated from the mucus membranes of winter flounder (Pseudopleuronectes americanus) and contributes to the initial stages of defense against bacterial infection. From NMR structural studies with the uniformly (15)N-labeled peptide, a structure of pleurocidin was determined to be in a random coil conformation in aqueous solution whereas it assumes an alpha-helical structure in TFE and in dodecylphosphocholine (DPC) micelles. From (15)N relaxation studies, the helix is a rigid structure in the membrane-mimicking environment. Strong NOESY cross-peaks from the pleurocidin to the aliphatic chain on DPC confirm that pleurocidin is contained within the DPC micelle and not associated with the surface of the micelle. From diffusion studies it was determined that each micelle contains at least two pleurocidin molecules.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,010
Score d'incertitude au seuil0,837

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,200
Écart entre enseignants0,192 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations74
Publié2005
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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