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Enregistrement W1988007672 · doi:10.1242/jcs.00374

Regulated secretion: SNARE density, vesicle fusion and calcium dependence

2003· article· en· W1988007672 sur OpenAlexaff
Jens R. Coorssen, Paul S. Blank, Fernando Albertorio, Ludmila Bezrukov, Irina Kolosova, Xiongfong Chen, Peter S. Backlund, Joshua Zimmerberg

Notice bibliographique

RevueJournal of Cell Science · 2003
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensUniversity of Calgary
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyCell biologyLipid bilayer fusionVesicleVesicle fusionSyntaxinSNAP25FusionFusion proteinSynaptotagmin 1SNARE complexExocytosisSynaptobrevinSecretionBiophysicsBiochemistrySynaptic vesicleMembraneRecombinant DNA

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

SNAREs such as VAMP, SNAP-25 and syntaxin are essential for intracellular trafficking, but what are their exact molecular roles and how are their interactions with other proteins manifest? Capitalizing on the differential sensitivity of SNAREs to exogenous proteases, we quantified the selective removal of identified SNAREs from native secretory vesicles without loss of fusion competence. Using previously established fusion assays and a high sensitivity immunoblotting protocol, we analyzed the relationship between these SNARE proteins and Ca2+-triggered membrane fusion. Neither the extent of fusion nor the number of intermembrane fusion complexes per vesicle were correlated with the measured density of identified egg cortical vesicle (CV) SNAREs. Without syntaxin, CVs remained fusion competent. Surprisingly, for one (but not another) protease the Ca2+ dependence of fusion was correlated with CV SNARE density, suggesting a native protein complex that associates with SNAREs, the architecture of which ensures high Ca2+ sensitivity. As SNAREs may function during CV docking in vivo, and as further proteolysis after SNARE removal eventually ablates fusion, we hypothesize that the triggered steps of regulated fusion (Ca2+ sensitivity and the catalysis and execution of fusion) require additional proteins that function downstream of SNAREs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,015
Score d'incertitude au seuil0,232

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,219 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations59
Publié2003
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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