Functional Insights Revealed by the Crystal Structures of Escherichia coli Glucose-1-phosphatase
Notice bibliographique
Résumé
The Escherichia coli periplasmic glucose-1-phosphatase is a member of the histidine acid phosphatase family and acts primarily as a glucose scavenger. Previous substrate profiling studies have demonstrated some of the intriguing properties of the enzyme, including its unique and highly selective inositol phosphatase activity. The enzyme is also potentially involved in pathogenic inositol phosphate signal transduction pathways via type III secretion into the host cell. We have determined the crystal structure of E. coli glucose-1-phosphatase in an effort to unveil the structural mechanism underlying such unique substrate specificity. The structure was determined by the method of multiwavelength anomalous dispersion using a tungstate derivative together with the H18A inactive mutant complex structure with glucose 1-phosphate at 2.4-A resolution. In the active site of glucose-1-phosphatase, there are two unique gating residues, Glu-196 and Leu-24, in addition to the conserved features of histidine acid phosphatases. Together they create steric and electrostatic constraints responsible for the unique selectivity of the enzyme toward phytate and glucose-1-phosphate as well as its unusually high pH optimum for the latter. Based on the structural characterization, we were able to derive simple structural principles that not only precisely explains the substrate specificity of glucose-1-phosphatase and the hydrolysis products of various inositol phosphate substrates but also rationalizes similar general characteristics across the histidine acid phosphatase family.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».