Conformation and other biophysical properties of cyclic antimicrobial peptides in aqueous solutions
Notice bibliographique
Résumé
As a step towards understanding the mechanism of the biological activity of cyclic antimicrobial peptides, the biophysical properties and conformations of four membrane-active cyclic peptide antibiotics, based on gramicidin S (GS), were examined in aqueous environments. These cyclic peptides, GS10 [cyclo(VKLdYP)2], GS12 [cyclo(VKLKdYPKVKLdYP)], GS14 [cyclo(VKLKVdYPLKVKLdYP)] and [d-Lys]4GS14 [cyclo(VKLdKVdYPLKVKLdYP)] (d-amino acid residues are denoted by d and are underlined) had different ring sizes of 10, 12 and 14 residues, were different in structure and amphipathicity, and covered a broad spectrum of hemolytic and antimicrobial activities. GS10, GS12 and [d-Lys]4GS14 were shown to be monomeric in buffer systems with ionic strength biological environments. GS14 was also monomeric at low concentrations, but aggregated at concentrations > 50 microm. The affinity of peptides for self-assembly and interaction with hydrophobic surfaces was related to their free energy of intermolecular interaction. The effects of variations in salt and organic solvent (trifluoroethanol) concentration and temperature on peptide conformation were also examined. Similar to GS, GS10 proved to have a stable and rather rigid conformation in different environments and over a broad range of temperatures, whereas GS12, GS14 and [d-Lys]4GS14 had more flexible conformations. Despite its conformational similarity to GS10, GS14 had unique physicochemical properties due to its tendency to aggregate at relatively low concentrations. The biophysical data explain the direct relation between structure, amphipathicity and hydrophobicity of the cyclic peptides and their hemolytic activity. However, this relation with the antimicrobial activity of the peptides is of a more complex nature due to the diversity in membrane structures of microorganisms.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».