hnRNP A1 and A/B Interaction with PABPN1 in Oculopharyngeal Muscular Dystrophy
Notice bibliographique
Résumé
BACKGROUND: Oculopharyngeal muscular dystrophy (OPMD) is an adult-onset disorder characterized by progressive ptosis, dysphagia and proximal limb weakness. The autosomal dominant form of this disease is caused by short expansions of a (GCG)6 repeat to (GCG) in the PABPN1 gene. The mutations lead to the expansion of a polyalanine stretch from 10 to 12-17 alanines in the N-terminus of PABPN1. The mutated PABPN1 (mPABPN1) induces the formation of intranuclear filamentous inclusions that sequester poly(A) RNA and are associated with cell death. METHODS: Human fetal brain cDNA library was used to look for PABPNI binding proteins using yeast two-hybrid screen. The protein interaction was confirmed by GST pull-down and co-immunoprecipitation assays. Oculopharyngeal muscular dystrophy cellular model and OPMD patient muscle tissue were used to check whether the PABPN1 binding proteins were involved in the formation of OPMD intranuclear inclusions. RESULTS: We identify two PABPNI interacting proteins, hnRNP A1 and hnRNP A/B. When co-expressed with mPABPN1 in COS-7 cells, predominantly nuclear protein hnRNP A1 and A/B co-localize with mPABPN1 in the insoluble intranuclear aggregates. Patient studies showed that hnRNP A1 is sequestered in OPMD nuclear inclusions. CONCLUSIONS: The hnRNP proteins are involved in mRNA processing and mRNA nucleocytoplasmic export, sequestering of hnRNPs in OPMD intranuclear aggregates supports the view that OPMD intranuclear inclusions are "poly(A) RNA traps", which would interfere with RNA export, and cause muscle cell death.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,002 | 0,004 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,002 |
| Études des sciences et des technologies | 0,002 | 0,006 |
| Communication savante | 0,001 | 0,001 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; les deux têtes enseignantes s’accordent sur ce qui est montré ici.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».