Proteomic Characterization of Protein Phosphatase Complexes of the Mammalian Nucleus
Notice bibliographique
Résumé
Our knowledge of the serine/threonine protein phosphatases of the mammalian nucleus is limited compared with their cytosolic counterparts. Microcystin-Sepharose chromatography and mass spectrometry were utilized to affinity purify and identify protein phosphatase-associated proteins from isolated rat liver nuclei. Far Western analysis with labeled protein phosphatase 1 (PP1) showed that many more PP1 binding proteins exist in the nucleus than were previously demonstrated. Mass spectrometry confirmed the presence in the nucleus of the mammalian PP1 isoforms alpha1, alpha2, beta, and gamma1, plus the Aalpha and several of the B and B' subunits that are complexed to PP2A. Other proteins enriched on the microcystin matrix include the spliceosomal proteins known as the U2 snRNPs SAP145 and SAP155 and the U5 snRNPs p116 and p200, myosin heavy chain, and a nuclear PP1 myosin-targeting subunit related to M110. The putative RNA binding protein ZAP was also established as a nuclear PP1 binding protein using the criteria of co-purification with PP1 on microcystin-Sepharose, co-immunoprecipation, binding PP1 in an overlay assay, and presence of a putative PP1 binding site (KKRVRWAD). These results further support a key role for protein phosphatases in several nuclear functions, including the regulation of pre-mRNA splicing.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».