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Enregistrement W1988346086 · doi:10.1139/b07-072

Extent and pattern of genetic differentiation within and between phenotypic populations of<i>Leymus chinensis</i>(Poaceae) revealed by AFLP analysis

2007· article· en· W1988346086 sur OpenAlexvenueno aff
Lei Gong, Xinxin Song, Mu Li, Wanli Guo, Lanjuan Hu, Qin Tian, Yang Yun-fei, Yufei Zhang, Xiaofang Zhong, Deli Wang, Liu B

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Botany · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic diversity and population structure
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésAmplified fragment length polymorphismBiologyLeymusPhenotypeEcotypePopulationGenetic diversityPhenotypic traitEvolutionary biologyGeneticsGenetic variationEcologyGeneGrassland

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The extent and pattern of genetic differentiation between two naturally occurring phenotypes, grey–green leaf (GGL) and yellow–green leaf (YGL), of Leymus chinensis (Trin.) Tzvel., which colonize distinct habitats in the Songnen Prairie in northeast China, were investigated by amplified fragment length polymorphism (AFLP) analysis. Twelve selected AFLP primer pairs amplified 593 reproducible bands, of which 148 (24.96%) were polymorphic among 69 individuals taken from three populations: two natural ones (YGL and GGL1) and one transplanted (GGL2). Cluster analysis based on the AFLP data categorized the plants into distinct groups that are in line with their phenotypes and population origins, thus denoting clear genetic differentiation between the two phenotypes. This, together with their adaptation to contrasting natural habitats, suggests that the two phenotypes probably represent stabilized ecotypes. The grouping was supported by multiple statistical analyses including Mantel’s test, principal coordinate analysis (PCOORDA), and analysis of molecular variance (AMOVA). The GGL phenotype harbors a higher level of within-population genetic diversity than YGL, possibly reflecting selection by habitat heterogeneity. Although GGL2 is largely similar to its original population (GGL1), further diversification since transplantation was evident. Sequence analysis of a subset of phenotype-specific or phenotype-enriched AFLP bands implicated diverse biological functions being involved in ecological adaptation and formation of the two phenotypes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,010
Tête enseignante GPT0,218
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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