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Enregistrement W1988346702 · doi:10.1071/fp08241

A PRp27 gene of Nicotiana benthamiana contributes to resistance to Pseudomonas syringae pv. tabaci but not to Colletotrichum destructivum or Colletotrichum orbiculare

2009· article· en· W1988346702 sur OpenAlexaff
Weilong Xie, Paul H. Goodwin

Notice bibliographique

RevueFunctional Plant Biology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant-Microbe Interactions and Immunity
Établissements canadiensUniversity of Guelph
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésPseudomonas syringaeBiologyNicotiana benthamianaMethyl jasmonateColletotrichumMicrobiologyHypersensitive responsePlant disease resistanceBotanyNicotianaColletotrichum acutatumNicotiana tabacumPathogenGeneSolanaceaeGeneticsInoculationHorticulture

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

NbPRp27 from Nicotiana benthamiana Domin. is highly similar to NtPRp27, which is a secreted protein from Nicotiana tabacum L. belonging to pathogen-inducible genes comprising the PR17 family of pathogenesis-related proteins. A collection of related genes from plants in several plant families showed that their deduced amino acid sequences clustered according to plant family. Expression of NbPRp27 was not detectable in healthy leaves or stems but was expressed at high levels in roots. Expression was induced by wounding, BTH, ethylene, methyl jasmonate, ABA and NAA, but not by drought, heat or cold stress. Expression was induced by infection with the hemibiotrophic pathogens, Colletotrichum destructivum, Colletotrichum orbiculare and Pseudomonas syringae pv. tabaci. For infections with the Colletotrichum species, expression increased more slowly during biotrophy than necrotrophy, but the reverse was true for P. syringae pv. tabaci. Virus-induced silencing of NbPRp27 did not affect the lesion number produced by the Colletotrichum species but did reduce basal resistance to P. syringae pv. tabaci permitting higher bacterial populations. Based on sequence similarities, PRp27 proteins have been hypothesised to have protease activity and may contribute to resistance by exhibiting direct antimicrobial activity in the apoplast, releasing of antimicrobial compounds from the plant matrix or releasing elicitors from pathogens to induce resistance.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,233
Écart entre enseignants0,210 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations14
Publié2009
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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