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Enregistrement W1988439466 · doi:10.2135/cropsci2010.06.0378

Nature of the Genetic Variation in an Elite Maize Breeding Cross

2010· article· en· W1988439466 sur OpenAlexafffund
Arti Singh, T. K. Coleman, M. Tollenaar, E. A. Lee

Notice bibliographique

RevueCrop Science · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetic Mapping and Diversity in Plants and Animals
Établissements canadiensUniversity of GuelphAgriculture and Agri-Food Canada
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésBiologyEpistasisInbred strainQuantitative trait locusGenetic variationLinkage disequilibriumHeritabilityGeneticsIdentity by descentSelection (genetic algorithm)AlleleHaplotypeGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Maize ( Zea mays L.) breeders through selection have had profound impacts on the maize genome. In this study we examine one aspect of this intense selection pressure, the extent and nature of genetic variation present in an elite maize breeding cross. Specifically genetic variation is examined with regards to genotype × environment interactions (G × E), magnitude of the genetic variance (Vg) estimates, and the underlying grain yield quantitative trait loci (QTL). Using two elite Iodent sister‐lines that are 64% identical by descent, 128 recombinant inbred lines (RILs) were generated and testcrossed to a Stiff Stalk inbred line (CG102). Hybrid RILs were grown in 24 trials encompassing 4 yr, three locations, and three planting densities. Additive main effects and multiplicative interaction analysis resolved the trials into eight unique patterns of G × E. Smaller Vg estimates were associated with the more frequently observed patterns of G × E. Nine single‐effect QTL and four epistatic interactions were detected across seven of the G × E patterns; however, the single‐effect QTL and epistatic interactions were, in general, specific to a G × E pattern. In summary, we found extensive linkage disequilibrium (LD), reduced Vg in the more commonly occurring G × E patterns, and genetic variation due to larger effect epistatic interactions and smaller single effect QTL specific to the G × E pattern. Consequences of the genetic variation are discussed in relation to modern maize breeding programs.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,797
Score d'incertitude au seuil0,139

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,258
Écart entre enseignants0,250 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations12
Publié2010
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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