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Enregistrement W1988456052 · doi:10.1074/jbc.m109.067868

Hypoxic Repression of Endothelial Nitric-oxide Synthase Transcription Is Coupled with Eviction of Promoter Histones

2009· article· en· W1988456052 sur OpenAlexafffund
Jason E. Fish, Matthew S. Yan, Charles Matouk, Rosanne St. Bernard, Jason Ho, Anna Gavryushova, Deepak Srivastava, Philip A. Marsden

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEpigenetics and DNA Methylation
Établissements canadiensSt. Michael's HospitalUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchUniversity of Toronto
Mots-clésHistoneEnosPsychological repressionTranscription (linguistics)BiologyChromatinCell biologyChromatin immunoprecipitationMolecular biologyPromoterNitric oxideGene expressionNitric oxide synthaseBiochemistryEndocrinologyGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Hypoxia elicits endothelial dysfunction, in part, through reduced expression of endothelial nitric-oxide synthase (eNOS). Here we present evidence that hypoxia causes a rapid decrease in the transcription of the eNOS/NOS3 gene, accompanied by decreased acetylation and lysine 4 (histone H3) methylation of eNOS proximal promoter histones. Surprisingly, we demonstrate that histones are rapidly evicted from the eNOS proximal promoter during hypoxia. We also demonstrate endothelium-specific H2A.Z incorporation at the eNOS promoter and find that H2A.Z is also evicted by hypoxic stimulation. After longer durations of hypoxia, histones are reincorporated at the eNOS promoter, but these histones lack substantial histone acetylation. Additionally, we identify a key role for the chromatin remodeler, BRG1, in re-establishing eNOS expression following reoxygenation of hypoxic cells. We posit that post-translational histone modifications are required to maintain constitutive eNOS transcriptional activity and that histone eviction rapidly resets histone marks and is a proximal event in the hypoxic repression of eNOS. Although nucleosome eviction has been reported in models of transcriptional activation, the observation that eviction can also accompany transcriptional repression in hypoxic mammalian cells argues that eviction may be broadly relevant to both positive and negative changes in transcription.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,334

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,256
Écart entre enseignants0,238 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations147
Publié2009
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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