Structure of a Sugar <i>N</i>-Formyltransferase from <i>Campylobacter jejuni</i>
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
The O-antigens, which are components of the outer membranes of Gram-negative bacteria, are responsible for the wide species variations seen in nature and are thought to play a role in bacterial virulence. They often contain unusual dideoxysugars such as 3,6-dideoxy-3-formamido-d-glucose (Qui3NFo). Here, we describe a structural and functional investigation of the protein C8J_1081 from Campylobacter jejuni 81116, which is involved in the biosynthesis of Qui3NFo. Specifically, the enzyme, hereafter referred to as WlaRD, catalyzes the N-formylation of dTDP-3,6-dideoxy-3-amino-d-glucose (dTDP-Qui3N) using N(10)-formyltetrahydrofolate as the carbon source. For this investigation, seven X-ray structures of WlaRD, in complexes with various dTDP-linked sugars and cofactors, were determined to resolutions of 1.9 Å or better. One of the models, with bound N(10)-formyltetrahydrofolate and dTDP, represents the first glimpse of an N-formyltransferase with its natural cofactor. Another model contains the reaction products, tetrahydrofolate and dTDP-Qui3NFo. In combination, the structures provide snapshots of the WlaRD active site before and after catalysis. On the basis of these structures, three amino acid residues were targeted for study: Asn 94, His 96, and Asp 132. Mutations of any of these residues resulted in a complete loss of enzymatic activity. Given the position of His 96 in the active site, it can be postulated that it functions as the active site base to remove a proton from the sugar amino group as it attacks the carbonyl carbon of the N-10 formyl group of the cofactor. Enzyme assays demonstrate that WlaRD is also capable of utilizing dTDP-3,6-dideoxy-3-amino-d-galactose (dTDP-Fuc3N) as a substrate, albeit at a much reduced catalytic efficiency.
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Prédiction distillée sur la base complète
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Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,009 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
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