MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1988497669 · doi:10.13171/mjc.2.2.2012.12.12.06

Differential protein expression in normal and trisomic cell lines from murine cerebral cortex measured by itraq and Mass Spectrometry

2012· article· en· W1988497669 sur OpenAlexafffund
Leigh E. Wicki‐Stordeur, Nesreen. Mohammed Al Faresi, Ahmed M. Almehdi, Derek Smith, Christoph H. Borchers, Terry W. Pearson, Jody D. Haddow

Notice bibliographique

RevueMediterranean Journal of Chemistry · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueGenetics and Neurodevelopmental Disorders
Établissements canadiensGenome British ColumbiaUniversity of Victoria
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaUnited Arab Emirates UniversityGenome CanadaUniversidad de ChileGenome British ColumbiaUniversity of Victoria
Mots-clésTrisomyChromosome 21Down syndromeProteomicsChemistryMolecular biologyPhenotypeCerebral cortexChromosomeCell cultureCell biologyBiologyGeneticsGeneBiochemistryNeuroscience

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Down syndrome (DS), the most common cause of genetic mental dysfunction, is caused by aberrant protein expression due to a trisomy of chromosome 21 (Ts21). A mouse model of Ts21, based on synteny of human chromosome 21 and murine chromosome 16, is used for studying the mechanisms involved in DS. In this study we measured protein expression in immortalized cell lines derived from normal and trisomy 16 (Ts16) fetal mouse cerebral cortex (CNh and CTb respectively). iTRAQ labeling and mass spectrometry were used to examine each cell line for significant up- or down-regulation of proteins. CTb cells showed increased expression of 71 proteins and decreased expression of 56 proteins when compared to the normal CNh control cells. Several of these differentially expressed proteins have previously been reported to show aberrant expression in DS and other neurological disorders such as Alzheimer’s disease, a condition closely associated with Down syndrome. Our results clearly demonstrate the aberrant expression of proteins with various cellular functions within the trisomy model and may lead to a deeper understanding of the proteins and mechanisms involved in the Down syndrome phenotype.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,022
Score d'incertitude au seuil0,652

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,204
Écart entre enseignants0,196 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations0
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueMediterranean Journal of ChemistryMême sujetGenetics and Neurodevelopmental DisordersTravaux en français237 207