Differential protein expression in normal and trisomic cell lines from murine cerebral cortex measured by itraq and Mass Spectrometry
Notice bibliographique
Résumé
Down syndrome (DS), the most common cause of genetic mental dysfunction, is caused by aberrant protein expression due to a trisomy of chromosome 21 (Ts21). A mouse model of Ts21, based on synteny of human chromosome 21 and murine chromosome 16, is used for studying the mechanisms involved in DS. In this study we measured protein expression in immortalized cell lines derived from normal and trisomy 16 (Ts16) fetal mouse cerebral cortex (CNh and CTb respectively). iTRAQ labeling and mass spectrometry were used to examine each cell line for significant up- or down-regulation of proteins. CTb cells showed increased expression of 71 proteins and decreased expression of 56 proteins when compared to the normal CNh control cells. Several of these differentially expressed proteins have previously been reported to show aberrant expression in DS and other neurological disorders such as Alzheimer’s disease, a condition closely associated with Down syndrome. Our results clearly demonstrate the aberrant expression of proteins with various cellular functions within the trisomy model and may lead to a deeper understanding of the proteins and mechanisms involved in the Down syndrome phenotype.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».