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Enregistrement W1988517155 · doi:10.1089/vim.2010.0043

Synthetic Antigens Representing the Antigenic Variation of Human Hepatitis C Virus

2010· article· en· W1988517155 sur OpenAlexaff
Kyung Hee Kang, Yasuhiro Yamamura, Maria P. Carlos, Nicolas Karvelas, In-Sup Kim, Deepa Sunkara, Rebecca Rivera, Murray B. Gardner, David E. Anderson, Francisco Díaz‐Mitoma, José V. Torres, Juan Pablo Márquez-Manríquez

Notice bibliographique

RevueViral Immunology · 2010
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueHepatitis C virus research
Établissements canadiensChildren's Hospital of Eastern Ontario
Organismes subventionnairesNational Center for Research Resources
Mots-clésEpitopeImmunogenicityVirologyAntigenHepatitis C virusAntibodyBiologyAntigenic variationImmune systemVirusHypervariable regionImmunologyHepacivirus

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Immune responses against hepatitis C virus (HCV) have been studied by numerous groups. However, details concerning the production of antibodies to antigenically variable epitopes remain to be elucidated. Since the sequences of the variable regions of several HCV proteins are different among the virus strains infecting patients, we decided to design peptide combinations that represent the theoretical maximum antigenic variation of each epitope to be used as capture antigens. We prepared six peptide mixtures (hypervariable epitope constructs; HECs) representing six different epitopes from structural and non-structural proteins of HCV from genotypes 1-6. Plasma from 300 HCV patients was tested to determine if their antibodies recognize the synthetic constructs. All the patients were chronically infected with diverse HCV genotypes and did not receive antiviral treatment. Antibodies to one or more of the HECs were detected in all of the HCV-infected individuals. Immunogenicity of the HCV HECs was also evaluated in outbred and inbred mice. Strong HEC-specific antibodies were produced, and cellular responses were also induced that were Th-1 rather than Th-2. Our results show that HCV HECs are both antigens that can be used to detect the broad cross-reactivity of antibodies from HCV-infected patients, and strong immunogens that can induce antigen-specific humoral and cellular immune responses in mice.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,657
Score d'incertitude au seuil0,998

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,022
Tête enseignante GPT0,323
Écart entre enseignants0,301 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations3
Publié2010
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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