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Enregistrement W1988537840 · doi:10.1128/jvi.74.23.11418-11421.2000

Identification of a Novel Consensus Sequence at the Cleavage Site of the Lassa Virus Glycoprotein

2000· article· en· W1988537840 sur OpenAlexaff
Oliver Lenz, Jan ter Meulen, Heinz Feldmann, Hans‐Dieter Klenk, Wolfgang Garten

Notice bibliographique

RevueJournal of Virology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueViral Infections and Outbreaks Research
Établissements canadiensHealth Canada
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyEdman degradationLassa virusGlycoproteinCleavage (geology)Peptide sequenceVirologyMolecular biologyProteolysisSequence motifVirusBiochemistryEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The Lassa virus glycoprotein consists of an amino-terminal and a carboxy-terminal cleavage fragment designated GP-1 and GP-2, respectively, that are derived by proteolysis from the precursor GP-C. The membrane-anchored GP-2 obtained from purified virions of the Josiah strain revealed the N-terminal tripeptide GTF(262) when analyzed by Edman degradation. Upstream of this site, GP-C contains the tetrapeptide sequence RRLL(259), which is conserved in all Lassa virus isolates published to date. Systematic mutational analysis of vector-expressed GP-C revealed that the motif R-X (L/I/V)-L(259) (where X stands for L, I, or V) is essential for cleavage of the peptide bond between leucine(259) and glycine(260). This cleavage motif is homologous to the consensus sequence recognized by a novel class of cellular endoproteases which have so far not been implicated in the processing of viral glycoproteins.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,160
Score d'incertitude au seuil0,436

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,038
Tête enseignante GPT0,340
Écart entre enseignants0,302 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations65
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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