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Enregistrement W1988544372 · doi:10.1111/maec.12076

<i><scp>T</scp>hioploca</i> spp. sheaths as niches for bacterial and protistan assemblages

2013· article· en· W1988544372 sur OpenAlexaff
Kurt R. Buck, James Barry, Steven Hallam

Notice bibliographique

RevueMarine Ecology · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineEnvironmental Science
ThématiqueMicrobial Community Ecology and Physiology
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesDavid and Lucile Packard Foundation
Mots-clésTrichomeBiologyProtistAbyssal zoneUltrastructureMicrobial matEcologyBotanyBacteriaCyanobacteriaPaleontologyFisheryBiochemistry

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Sulfide oxidizing bacterial mats are common in regions of the continental shelves characterized by high primary production and the resultant oxygen minimum zone. These mats are made up of several species of Beggiatoa and/or Thioploca, which oxidize sulfide that is generated in the sediment. Thioploca spp. inhabit a large polysaccharide sheath that encompasses bundles of 1–20 filaments (trichomes), each ranging from 3 to 60 μm in diameter. This sheath has been shown to be a critical component of the autecology of Thioploca. Analysis of Thioploca from cold seeps in Monterey Bay using light and transmission electron microscopy identified new and diverse microbial assemblages associated with interstitial spaces between trichomes, inside the sheath. Small diameter, non‐vacuolate, filamentous prokaryotes were numerous. Amoebae, euglenozoa, ciliates and other protists of unknown affiliation were observed in sheaths. Most of the protists possessed food vacuoles and some protists showed ultrastructural evidence of endosymbionts. These observations suggest that Thioploca sheaths may serve as oases on the sea floor, providing nutritional and detoxification services to previously unrecognized microbial partners.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,004
Score d'incertitude au seuil0,008

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0000,001
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,212
Écart entre enseignants0,205 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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