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Enregistrement W1988809140 · doi:10.1099/mic.0.056374-0

Identification of a novel adhesin involved in acid-induced adhesion of enterohaemorrhagic Escherichia coli O157 : H7

2012· article· en· W1988809140 sur OpenAlexaff
Frances B Chingcuanco, Yijing Yu, Julianne V. Kus, Tracy Lackraj, Céline M. Lévesque, Debora Barnett Foster

Notice bibliographique

RevueMicrobiology · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueEscherichia coli research studies
Établissements canadiensUniversity of TorontoToronto Metropolitan University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBacterial adhesinMutantAdhesionEscherichia coliVirulenceMicrobiologyBiologyComplementationDownregulation and upregulationWild typeAntiserumEnterobacteriaceaeGeneChemistryBiochemistryGeneticsAntibody

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Enterohaemorrhagic Escherichia coli (EHEC) survives exposure to acute acid stress during gastric passage and progresses to colonize the large intestine. We previously reported that acid stress significantly increases host adhesion of EHEC O157 : H7 and is associated with a coincident upregulation of the expression of a putative adhesin gene, yadK. Further gene expression analysis now confirms that yadK is minimally transcribed under unstressed conditions and is significantly upregulated under acid stress. Immunoblotting with an anti-YadK polyclonal antiserum demonstrates that YadK protein is also upregulated after acid stress. Disruption of yadK results in loss of the acid-induced adhesion increase seen for wild-type EHEC to human epithelial cells in vitro and complementation in trans fully restores the acid-induced adhesion phenotype to the wild-type level. Significantly, no difference is observed in adhesion of the unstressed yadK mutant relative to wild-type, indicating that YadK does not play a role in adhesion of unstressed EHEC. Anti-YadK antiserum inhibits the acid-induced adhesion enhancement of EHEC but has no effect on adhesion of unstressed EHEC. There is no significant difference in the viability of either the unstressed or the acid-stressed yadK mutant relative to the similarly treated wild-type, suggesting that yadK is not involved in acid tolerance. These results provide persuasive evidence that YadK plays a significant role in the adhesion of acid-stressed EHEC to epithelial cells, and support a role for acid stress as a factor which may regulate bacteria-host attachment and lead to increased EHEC colonization and virulence.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,625

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,028
Tête enseignante GPT0,288
Écart entre enseignants0,260 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations21
Publié2012
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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