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Enregistrement W1988860478 · doi:10.1128/mcb.02141-06

Sequential Activation of Poly(ADP-Ribose) Polymerase 1, Calpains, and Bax Is Essential in Apoptosis-Inducing Factor-Mediated Programmed Necrosis

2007· article· en· W1988860478 sur OpenAlexaff
Rana S. Moubarak, Vı́ctor J. Yuste, Cédric Artus, Aïda Bouharrour, Peter A. Greer, Josiane Ménissier‐de Murcia, Santos A. Susín

Notice bibliographique

RevueMolecular and Cellular Biology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCell death mechanisms and regulation
Établissements canadiensQueen's University
Organismes subventionnairesHoward Hughes Medical Institute
Mots-clésPoly ADP ribose polymeraseApoptosis-inducing factorBiologyProgrammed cell deathApoptosisDNA fragmentationDNA damageMolecular biologyCaspaseCalpainNecrosisCell biologyPARP inhibitorPolymeraseBiochemistryDNAGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Alkylating DNA damage induces a necrotic type of programmed cell death through the poly(ADP-ribose) polymerases (PARP) and apoptosis-inducing factor (AIF). Following PARP activation, AIF is released from mitochondria and translocates to the nucleus, where it causes chromatin condensation and DNA fragmentation. By employing a large panel of gene knockout cells, we identified and describe here two essential molecular links between PARP and AIF: calpains and Bax. Alkylating DNA damage initiated a p53-independent form of death involving PARP-1 but not PARP-2. Once activated, PARP-1 mediated mitochondrial AIF release and necrosis through a mechanism requiring calpains but not cathepsins or caspases. Importantly, single ablation of the proapoptotic Bcl-2 family member Bax, but not Bak, prevented both AIF release and alkylating DNA damage-induced death. Thus, Bax is indispensable for this type of necrosis. Our data also revealed that Bcl-2 regulates N-methyl-N'-nitro-N'-nitrosoguanidine-induced necrosis. Finally, we established the molecular ordering of PARP-1, calpains, Bax, and AIF activation, and we showed that AIF downregulation confers resistance to alkylating DNA damage-induced necrosis. Our data shed new light on the mechanisms regulating AIF-dependent necrosis and support the notion that, like apoptosis, necrosis could be a highly regulated cell death program.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,003

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,241
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations316
Publié2007
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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