The use of anonymous DNA markers in assessing worldwide relatedness in the yeast species<i>Pichia kluyveri</i>Bedford and Kudrjavzev
Pourquoi ce travail est dans la base
Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.
Notice bibliographique
Résumé
Pichia kluyveri, a sexual ascomycetous yeast from cactus necroses and acidic fruit, is divided into three varieties. We used physiological, RAPD, and AFLP data to compare 46 P. kluyveri strains collected worldwide to investigate relationships among varieties. Physiology did not place all strains into described varieties. Although the combined AFLP and RAPD data produced a single most parsimonious tree, separate analysis of AFLP and RAPD data resulted in significantly different trees (by the partition homogeneity test). We then compared the distribution of strains per band to an expected distribution. This suggested we could separate both the AFLP and RAPD datasets into bands from rapidly and slowly changing DNA regions. When only bands from slowly changing regions (from each dataset) were included in the analysis, both the RAPD and AFLP datasets supported a single tree. This second tree did not differ significantly from the cladogram based on all of the DNA data, which we accepted as the best estimate of the phylogeny of these yeast strains. Based on this phylogeny, we were able to demonstrate the strong influence of geography on the population structure of this yeast, confirm the monophyly of one variety, question the utility of maintaining another variety, and demonstrate that the physiological differences used to separate the varieties did not do so in all cases.
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle