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Enregistrement W1989079357 · doi:10.1002/stem.712

The RNA-Binding Protein Unr Prevents Mouse Embryonic Stem Cells Differentiation Toward the Primitive Endoderm Lineage

2011· article· en· W1989079357 sur OpenAlexaff
Habiba Elatmani, Virginie Dormoy-Raclet, Pierre Dubus, François Dautry, Claire Chazaud, Hélène Jacquemin‐Sablon

Notice bibliographique

RevueStem Cells · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiquePluripotent Stem Cells Research
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesInstitut National de la Santé et de la Recherche Médicale
Mots-clésBiologyEndodermEmbryonic stem cellLineage (genetic)RNA-binding proteinCell biologyStem cellRNACellular differentiationGeneticsGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The maintenance of embryonic stem cells (ESCs) pluripotency depends on key transcription factors, chromatin remodeling proteins, and microRNAs. The roles of RNA-binding proteins are however poorly understood. We report that the cytoplasmic RNA-binding protein Unr prevents the differentiation of ESCs into primitive endoderm (PrE). We show that unr knockout (unr(-/-) ) ESCs spontaneously differentiate into PrE, and that Unr re-expression in unr(-/-) ESCs reverses this phenotype. Nevertheless, unr(-/-) ESCs retain pluripotency, producing differentiated teratomas, and the differentiated unr(-/-) ESCs coexpress the PrE inducer Gata6 and the pluripotency factors Oct4, Nanog, and Sox2. Interestingly, in the differentiated unr(-/-) ESCs, Nanog and Sox2 exhibit a dual nuclear and cytoplasmic localization. This situation, that has never been reported, likely reflects an early differentiation state toward PrE. Finally, we show that Unr destabilizes Gata6 mRNAs and we propose that the post-transcriptional repression of Gata6 expression by Unr contributes to the stabilization of the ESCs pluripotent state.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,002
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0020,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,030
Tête enseignante GPT0,245
Écart entre enseignants0,215 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations57
Publié2011
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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