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Enregistrement W1989197193 · doi:10.1071/rdv26n1ab93

93 SEX-SPECIFIC DEVELOPMENTAL PROGRAMMING OF THE BOVINE EMBRYO BY COLONY STIMULATING FACTOR 2 (CSF2)

2013· article· en· W1989197193 sur OpenAlexaffabout
Kyle B. Dobbs, Dominic Gagné, Emmanuelle Fournier, Isabelle Dufort, Claude Robert, J. Block, Marc‐André Sirard, L. Bonilla, Alan D. Ealy, Per Juel Hansen

Notice bibliographique

RevueReproduction Fertility and Development · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueAnimal Genetics and Reproduction
Établissements canadiensUniversité Laval
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésConceptusEmbryo cultureAndrologyEmbryoBiologyInseminationUterusDNA methylationPregnancyAnimal scienceEmbryogenesisInternal medicineFetusEndocrinologyMedicineGeneticsGene expression

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Competence of the bovine embryo to establish pregnancy can be enhanced by treatment with colony stimulating factor 2 (CSF2) from Days 5 to 7 post-insemination. The mechanism is unknown but could involve developmental reprogramming. Here, we questioned whether treatment with CSF2 from Days 5 to 7 alters growth, interferon-t (IFNT) secretion, and the methylome of extra-embryonic membranes (EEM) at Day 15. In vitro-produced embryos were treated with either 0 or 10 ng mL–1 bovine CSF2 from Days 5 to 7. Expanded blastocysts were transferred into synchronized recipients. On Day 15, conceptuses were recovered by flushing the uterus and sex determined by PCR (n = 4 males and 4 females per treatment). Statistical analysis of IFNT and length was performed using analysis of variance with the general linear models procedure of SAS (SAS Institute Inc., Cary, NC, USA). There was a sex × treatment interaction for conceptus length (P < 0.003) and IFNT in uterine flushing (P < 0.05) (as determined by antiviral activity). CSF2 increased length in males (least squares means ± s.e.m.: 93 ± 19 mm v. 20 ± 19 mm) and decreased length in females (22 ± 19 mm v. 103 ± 19). Similarly, CSF2 increased IFNT in males (45 483 ± 22 615 IU mL–1v. –2536.27 ± 13 385 IU mL–1) and decreased IFNT in females (–14 012 ± 13 642 IU mL–1v. 35 404 ± 7514.91 IU mL–1). The EmbryoGENE DNA Methylation Array (Edmonton, AB, Canada) was used to assess CSF2 effects at 418 805 positions across the genome in a subset of EEM (n = 2 for vehicle and 4 for CSF2 in males; n = 3 for vehicle and n = 3 for CSF2 in females). CSF2 caused hypermethylation for 9842 probes in males and 6227 probes in females and hypomethylation for 9322 probes in males and 3292 probes in females. An analysis was conducted to evaluate if clusters of differentially-methylated probes were non-randomly distributed spatially in 5 Mb regions of individual chromosomes using a 500-kb moving window. Statistical significance was determined using chi-squared tests for each 500-kb window. Differential methylation was not uniformly distributed but rather there were regions or hyper- and hypomethylation that varied with sex. The most common situation was where a region was differentially methylated in one sex but not the other. In some cases, a region was differentially methylated in opposite directions for males and females. For example, a region of BTA1 between positions 67 Mb–77.5 Mb contained 1632 probes, of which 59 probes were hypo-methylated in males and 35 were hypermethylated in females. In conclusion, changes in developmental programming of the bovine embryo caused by CSF2 occur in a sex-specific manner. This result suggests a possible mechanism by which environmental effects on the female affect male embryos differently than female embryos. Support was provided by U.S. Department of Agriculture (USDA) National Institute of Food and Agriculture (NIFA) grant 2011-67015-30688.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,370
Score d'incertitude au seuil0,497

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,018
Tête enseignante GPT0,228
Écart entre enseignants0,211 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations2
Publié2013
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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