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Enregistrement W1989262529 · doi:10.1097/pdm.0b013e318150d67c

Germline SDHB Mutations are Common in Patients With Apparently Sporadic Sympathetic Paragangliomas

2008· article· en· W1989262529 sur OpenAlexaff
Roger D. Klein, Long Jin, Kandelaria M. Rumilla, William F. Young, Ricardo V. Lloyd

Notice bibliographique

RevueDiagnostic Molecular Pathology · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueAdrenal and Paraganglionic Tumors
Établissements canadiensInstitute of Nutrition, Metabolism and Diabetes
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLoginLogo (programming language)World Wide WebComputer scienceInternet privacyComputer security

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Germline mutations in the genes encoding the B (SDHB) and D (SDHD) subunits of the heterotetrameric protein succinate dehydrogenase (mitochondrial complex II) are important causes of inherited and apparently sporadic paragangliomas. In an effort to further investigate the role of these genes in malignant sympathetic paragangliomas and adrenal pheochromocytomas, we screened a series of tumors for mutations in SDHB and SDHD. Mutation testing was performed on DNA extracted from formalin-fixed, paraffin-embedded tumors and associated normal tissues by polymerase chain reaction amplification and direct sequencing of the coding regions and intron-exon junctions of the SDHB and SDHD genes. Among 16 malignant paragangliomas with proven metastases, 6 (38%) had mutations in SDHB (2 nonsense, 1 splice site, 1 insertion causing a frameshift, and 2 presumably deleterious missense mutations). Probable deleterious SDHB variants were also detected in 5 (45%) of 11 paragangliomas without known metastatic disease (1 splice site, 1 deletion causing a frameshift, and 3 missense changes). In 12 malignant pheochromocytomas, 1 SDHD and no SDHB mutations were identified. The identical SDHB mutation was detected in DNA extracted from accompanying normal tissue for each of the 10 cases on which this analysis was performed. An excess of SDHB mutations in paragangliomas versus pheochromocytomas was found, with no difference in the frequency of mutations in malignant versus benign paragangliomas. The disparate mutational spectra in malignant paragangliomas and pheochromocytomas may reflect differences in underlying tumor biology.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,214
Score d'incertitude au seuil0,929

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0000,001
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,007
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,216 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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