Felic (CIP4b), a novel binding partner with the Src kinase Lyn and Cdc42, localizes to the phagocytic cup
Notice bibliographique
Résumé
Through its Src homology 3 (SH3) and SH2 domains, the Src kinase Lyn interacts with a small number of phosphoproteins, such as Shc, Cbl, and Vav, which regulate cell cycle and the cytoskeleton. Using Lyn's Unique, SH3, and SH2 domains as bait in a yeast 2-hybrid screen, we isolated a novel gene product with features of a scaffolding protein. We named it Felic because it contains a domain homologous to the tyrosine kinase Fes and the cytoskeletal protein ezrin and forms a Lyn interaction with the GTPase Cdc42 (Felic). Felic was expressed in both hematopoietic and nonhematopoietic tissues. Because it represents an alternative splice product related to the Cdc42-interacting protein 4, CIP4, we also refer to Felic as CIP4b. Felic contains an SH3 recognition site RXPXXP and multiple tyrosine residues. In insulin or serum-stimulated HEK293 cells, Felic became tyrosine phosphorylated. Like CIP4, Felic associated with Cdc42 in its activated form only. Unlike CIP4, Felic does not possess a C-terminal SH3 domain. Coprecipitation studies show that Felic bound to Lyn or activated forms of Cdc42. Overexpression of Felic or CIP4 inhibited NIH 3T3 cell invasiveness in a Matrigel assay. Because Lyn and Cdc42 are involved in phagocytosis, we examined the distribution of Felic in RAW macrophages during particle ingestion. Felic was recruited more efficiently than CIP4 to the phagocytic cups. Altogether, these data suggest that CIP4/Felic constitute a novel family of cytoskeletal scaffolding proteins, integrating Src and Cdc42 pathways. The absence of an SH3 domain in Felic provides a structural basis for functional differences.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».