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Enregistrement W1989387938 · doi:10.4161/cc.5.11.2784

Y-box Binding Protein 1: Providing a New Angle on Translational Regulation

2006· review· en· W1989387938 sur OpenAlexafffund
Valentina Evdokimova, Lev P. Ovchinnikov, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueCell Cycle · 2006
Typereview
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueRNA Research and Splicing
Établissements canadiensChild and Family Research InstituteUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesRussian Academy of SciencesChild and Family Research Institute
Mots-clésEIF4ETranslational regulationBiologyRepressorCell biologyTranslation (biology)Messenger RNAPI3K/AKT/mTOR pathwayPhosphorylationGene silencingTranslational efficiencyInternal ribosome entry siteSignal transductionGeneticsGene expressionGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Current models of translational regulation are mostly focused on how translational factors engage a messenger mRNA to the ribosome to initiate translation. Since the majority of mRNAs in eukaryotes are translated in a cap-dependent manner, the mRNA 5' cap-binding protein eIF4E was characterized as a key player responsible for the recruitment of mRNAs to the initiation complex. The availability of eIF4E is believed to be especially critical for translational activation of mRNAs with extensive secondary structures in their 5'UTRs, many of which code for labile regulatory proteins essential for cell growth or viability. Surprisingly, little attention is paid to the other side of translational control, e.g., to define mechanisms responsible for translational silencing and storage of the above messages. In this review, we discuss the possibility that eIF4E per se may not be sufficient to release mRNAs from translational block. We found that many growth- and stress-related mRNAs are associated with the translational repressor YB-1, which can compete with the eIF4E-driven translation initiation complex for binding to the capped 5' mRNA terminus. Moreover, the cap-dependent repressor activity of YB-1 appears to be negatively regulated via Akt-mediated phosphorylation of the Ser-102 residue of YB-1. Taken together with recent evidence suggesting that translational activation of growth-related messages is a primary cellular response to activation of Ras-Erk and PI3K-Akt signaling pathways, our data suggest that differential expression of specific mRNA subsets is regulated by the PI3K-Akt pathway and achieved via coordinated activation of the components of translational machinery and inactivation of general translational repressors such as YB-1.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Sans objet · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Synthèse · Signal consensuel: Synthèse
Score de désaccord entre enseignants0,003
Score d'incertitude au seuil0,010

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,001
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0000,002
Communication savante0,0020,004
Science ouverte0,0010,001
Intégrité de la recherche0,0020,005
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,303
Écart entre enseignants0,274 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeSans objet
Domainenon disponible
GenreSynthèse

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations120
Publié2006
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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