Electrospray mass spectrometry of neuac oligomers associated with the c fragment of the tetanus toxin
Notice bibliographique
Résumé
The Clostridial neurotoxins, botulinum and tetanus, gain entry into motor neurons by binding to the sialic or N-acetylneuraminic acid (NeuAc) residues of gangliosides and specific protein receptors attached to the cell's surface. While the C-fragment of tetanus toxin (TetC) has been identified to be the ganglioside binding domain, remarkably little is known about how this domain discriminates between the structural features of different gangliosides. We have used electrospray ionization mass spectrometry (ESI-MS) to examine the formation of complexes between TetC and carbohydrates containing NeuAc groups to determine how NeuAc residues contribute to ganglioside binding. ESI-MS was used to obtain an estimate of the dissociation constants (KD values) for TetC binding to a number of related NeuAc-containing carbohydrates (sialyllactose and disialyllactose), as well as six (NeuAc)n oligomers (n = 1-6). KD values were found to range between approximately 10-35 microM. The strength of the interactions between the C fragment and (NeuAc)n are consistent with the topography of the targeting domain of tetanus toxin and the nature of its carbohydrate binding sites. These results suggest that the targeting domain of tetanus toxin contains two binding sites that can accommodate NeuAc (or a dimer) and that NeuAc may play an important role in ganglioside binding and molecular recognition, a process critical for normal cell function and one frequently exploited by toxins, bacteria, and viruses to facilitate their entrance into cells.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,002 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».