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Enregistrement W1989507463 · doi:10.1042/bj20041915

Identification and assessment of the role of a nominal phospholipid binding region of ORP1S (oxysterol-binding-protein-related protein 1 short) in the regulation of vesicular transport

2005· article· en· W1989507463 sur OpenAlexafffund
Gregory D. Fairn, Christopher R. McMaster

Notice bibliographique

RevueBiochemical Journal · 2005
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueCellular transport and secretion
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesIWK Health Centre
Mots-clésVesicular transport proteinBiologyCell biologyBiochemistryGolgi apparatusPhospholipidTransport proteinVesicleEndoplasmic reticulumMembrane

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The ORPs (oxysterol-binding-protein-related proteins) constitute an enigmatic family of intracellular lipid receptors that are related through a shared lipid binding domain. Emerging evidence suggests that ORPs relate lipid metabolism to membrane transport. Current data imply that the yeast ORP Kes1p is a negative regulator of Golgi-derived vesicular transport mediated by the essential phosphatidylinositol/phosphatidylcholine transfer protein Sec14p. Inactivation of Kes1p function allows restoration of growth and vesicular transport in cells lacking Sec14p function, and Kes1p function in this regard can be complemented by human ORP1S (ORP1 short). Recent studies have determined that Kes1p and ORP1S both bind phospholipids as ligands. To explore the function of distinct linear segments of ORP1S in phospholipid binding and vesicular transport regulation, we generated a series of 15 open reading frames coding for diagnostic regions within ORP1S. Purified versions of these ORP1S deletion proteins were characterized in vitro, and allowed the identification of a nominal phospholipid binding region. The in vitro analysis was interpreted in the context of in vivo growth and vesicle transport assays for members of the ORP1S deletion set. The results determined that the phospholipid binding domain per se was insufficient for inhibition of vesicular transport by ORP1S, and that transport of carboxypeptidase Y and invertase from the Golgi may be regulated differentially by specific regions of ORP1S/Kes1p.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,036
Score d'incertitude au seuil0,284

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,229
Écart entre enseignants0,221 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations30
Publié2005
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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