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Enregistrement W1989543541 · doi:10.1097/00000478-200007000-00005

Molecular Detection of the ETV6-NTRK3 Gene Fusion Differentiates Congenital Fibrosarcoma From Other Childhood Spindle Cell Tumors

2000· article· en· W1989543541 sur OpenAlexaff
Jacqueline M. Bourgeois, Stevan R. Knezevich, Joan Mathers, Poul H. Sorensen

Notice bibliographique

RevueThe American Journal of Surgical Pathology · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueSoft tissue tumor case studies
Établissements canadiensMcMaster University Medical Centre
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésETV6Fusion genePathologyGeneFibrosarcomaBiologyCancer researchMedicineGeneticsChromosomal translocation

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Congenital fibrosarcoma (CFS) is a pediatric spindle cell tumor of the soft tissues that usually presents before the age of 2 years. Although these tumors display histologic features of malignancy and frequently recur, they have a relatively good prognosis and only rarely metastasize. CFS must therefore be differentiated from more aggressive spindle cell sarcomas that occur during childhood, particularly adult-type fibrosarcoma (ATFS), which can have an identical morphology. CFS must also be distinguished from benign but cellular fibroblastic lesions of the same age group, including infantile fibromatosis (IFB) and myofibromatosis (MFB). Unfortunately, standard pathologic examination often does not differentiate CFS from these other conditions. The authors recently identified a novel chromosomal translocation in CFS, t(12;15)(p13;q25), which gives rise to an ETV6-NTRK3 gene fusion. They subsequently developed reverse transcription-polymerase chain reaction (RT-PCR) assays that can detect ETV6-NTRK3 fusion transcripts in CFS frozen or paraffin-embedded tumor specimens. To confirm the use of this assay in the differential diagnosis of CFS, they have screened a larger series of childhood pediatric spindle cell lesions for ETV6-NTRK3 gene fusions, including 11 cases of CFS, 13 malignant spindle cell tumors (including ATFS), and 38 benign spindle cell tumors (including IFB and MFB). Of the 11 cases diagnosed as CFS, 10 showed the ETV6-NTRK3 gene fusion, whereas none of the 51 other malignant or benign spindle cell tumors demonstrated this fusion gene. They also compared their RT-PCR findings with those of conventional cytogenetics and with immunohistochemical detection of the ETV6-NTRK3 protein using antisera to NTRK3. They conclude that RT-PCR analysis is superior to these techniques for the detection of the ETV6-NTRK3 gene fusion in pediatric spindle cell tumors, and it is a reliable and specific modality for the diagnosis of CFS.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,002

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0010,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,006
Tête enseignante GPT0,223
Écart entre enseignants0,217 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations332
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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