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Enregistrement W1989623500 · doi:10.1158/1535-7163.pms-b16

Abstract B16: Cells containing mutations in the cohesin component, STAG2, are sensitive to PARP inhibition

2013· article· en· W1989623500 sur OpenAlexaff
Melanie L. Bailey, Nigel J. O’Neil, Derek M. van Pel, Phil Hieter

Notice bibliographique

RevueMolecular Cancer Therapeutics · 2013
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMicrotubule and mitosis dynamics
Établissements canadiensUniversity of British Columbia
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCohesinSynthetic lethalityOlaparibEstablishment of sister chromatid cohesionBiologyCancer cellChromosome instabilityCancer researchMolecular biologyPARP1Genome instabilityGeneticsCancerDNA repairDNA damagePoly ADP ribose polymeraseChromosomeDNAPolymeraseGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Abstract Synthetic lethality (SL) has been proposed as a strategy to specifically target cells harboring cancer mutations while leaving unmutated, non-cancer cells unaffected, thus minimizing drug side effects. One genetic vulnerability common to many types of cancer is chromosome instability (or CIN). CIN can lead to increased genetic mutation and aneuploidy in cancer cells thereby distinguishing them from their normal neighbors and making it a possible candidate phenotype to target by SL. Here, we focus on the multifunctional cohesin complex that is critical for accurate chromosome segregation and genome stability because it tethers sister chromatids together after DNA replication and maintains cohesion until their separation in anaphase. Although several subunits of cohesin have been shown to be mutated in tumors, recent data identifies a cohesin component, STAG2 (Stromal Antigen 2 or SA-2) as a highly mutated gene in several types of cancer including Ewing's sarcoma, melanoma and glioblastomas (GBMs). As a previous study in our lab had shown that knockdown of any one of the core cohesion subunits SMC1A, SMC3 or RAD21 can render cells sensitive to the poly ADP-ribose polymerase (PARP) inhibitor olaparib, we sought to determine if cell lines harboring cancer-specific STAG2 mutations showed similar sensitivity. Using paired GBM cell lines containing either a truncated STAG2 or wild-type STAG2 knock-in, we found that STAG2 mutation status was, indeed, associated with significantly decreased proliferation in the presence of PARP inhibition. Interestingly, olaparib treatment led to an accumulation of cells in the G2 phase of the cell cycle and an increase in DNA damage markers. Furthermore, in the presence of increasing concentrations of olaparib, a higher percentage of STAG2-mutated cells had micronuclei and fragmented nuclei compared to their wild-type STAG2 knock-in counterparts. Taken together, these data suggest that the DNA repair enzyme PARP may be a potential therapeutic SL target for tumors harboring mutations in STAG2. Citation Format: Melanie L. Bailey, Nigel J. O'Neil, Derek M. van Pel, Phil Hieter. Cells containing mutations in the cohesin component, STAG2, are sensitive to PARP inhibition. [abstract]. In: Proceedings of the AACR Precision Medicine Series: Synthetic Lethal Approaches to Cancer Vulnerabilities; May 17-20, 2013; Bellevue, WA. Philadelphia (PA): AACR; Mol Cancer Ther 2013;12(5 Suppl):Abstract nr B16.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,024
Score d'incertitude au seuil0,668

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,017
Tête enseignante GPT0,266
Écart entre enseignants0,249 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2013
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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