<i>Pseudomonas aeruginosa</i> produces an extracellular deoxyribonuclease that is required for utilization of DNA as a nutrient source
Notice bibliographique
Résumé
Pseudomonas aeruginosa is an opportunistic pathogen that occupies a wide variety of environmental niches. Extracellular DNA is ubiquitous in various environments and is a rich source of carbon, nitrogen and phosphate. Here we show that P. aeruginosa is capable of using DNA as a nutrient source. Under phosphate-limiting conditions, or when DNA is supplied as a source of phosphate, expression of PA3909 is induced. PA3909 encodes an extracellular deoxyribonuclease (DNase), which is required for degradation of DNA and utilization of DNA as a source of carbon, nitrogen and phosphate. Stabilization of PA3909 by the addition of excess Mg(2+) and Ca(2+) was required for DNase activity in culture supernatants. Extracellular DNase activity was seen in multiple P. aeruginosa strains and isolates from cystic fibrosis patients. The primary Xcp type II secretion system but not the Hxc type II secretion system is required for DNase activity and the ability to use DNA as a source of nutrients. This study identifies an extracellular DNase produced by P. aeruginosa that enables degradation of extracellular DNA into an accessible source of carbon, nitrogen and phosphate. DNase production by P. aeruginosa also has important implications for virulence and biofilm formation.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».