MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1989779951 · doi:10.1074/jbc.m111.237412

Double Mutant Cycle Analysis Identified a Critical Leucine Residue in the IIS4S5 Linker for the Activation of the CaV2.3 Calcium Channel

2011· article· en· W1989779951 sur OpenAlexafffund
Sébastien Wall-Lacelle, Md. Israil Hossain, Rémy Sauvé, Rikard Blunck, Lucie Parent

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2011
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversité de Montréal
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchHeart and Stroke Foundation of Canada
Mots-clésGatingChemistryMutantLinkerLeucineStereochemistryBiophysicsCrystallographyBiochemistryAmino acidBiology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Mutations in distal S6 were shown to significantly alter the stability of the open state of Ca(V)2.3 (Raybaud, A., Baspinar, E. E., Dionne, F., Dodier, Y., Sauvé, R., and Parent, L. (2007) J. Biol. Chem. 282, 27944-27952). By analogy with K(V) channels, we tested the hypothesis that channel activation involves electromechanical coupling between S6 and the S4S5 linker in Ca(V)2.3. Among the 11 positions tested in the S4S5 linker of domain II, mutations of the leucine residue at position 596 were found to destabilize significantly the closed state with a -50 mV shift in the activation potential and a -20 mV shift in its charge-voltage relationship as compared with Ca(V)2.3 wt. A double mutant cycle analysis was performed by introducing pairs of glycine residues between S4S5 and S6 of Domain II. Strong coupling energies (ΔΔG(interact) > 2 kcal mol(-1)) were measured for the activation gating of 12 of 39 pairs of mutants. Leu-596 (IIS4S5) was strongly coupled with distal residues in IIS6 from Leu-699 to Asp-704. In particular, the double mutant L596G/I701G showed strong cooperativity with a ΔΔG(interact) ≈6 kcal mol(-1) suggesting that both positions contribute to the activation gating of the channel. Altogether, our results highlight the role of a leucine residue in S4S5 and provide the first series of evidence that the IIS4S5 and IIS6 regions are energetically coupled during the activation of a voltage-gated Ca(V) channel.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,028
Score d'incertitude au seuil0,167

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,073
Tête enseignante GPT0,305
Écart entre enseignants0,232 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2011
Routes d'admission2
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueJournal of Biological ChemistryMême sujetIon channel regulation and functionTravaux en français237 207