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Enregistrement W1989841664 · doi:10.1074/jbc.m709682200

Determinants That Control the Distinct Subcellular Localization of p38α-PRAK and p38β-PRAK Complexes

2008· article· en· W1989841664 sur OpenAlexfundno aff
Qinxi Li, Na Zhang, Duanwu Zhang, Yuqian Wang, Tianwei Lin, Yanhai Wang, Huamin Zhou, Zhiyun Ye, Faming Zhang, Sheng-Cai Lin, Jiahuai Han

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueMelanoma and MAPK Pathways
Établissements canadiensnon disponible
Organismes subventionnairesProject 211Canadian Institutes of Health ResearchNational Natural Science Foundation of China
Mots-clésSubcellular localizationNuclear localization sequencep38 mitogen-activated protein kinasesBiologyProtein kinase ACell biologyKinaseBiochemistryNucleusCytoplasm

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

p38alpha and p38beta MAPKs (mitogen-activated protein kinases) share about 80% of their protein sequence identity, but have quite different biological functions. One such difference is in regulating the subcellular localization of their downstream kinases, such as PRAK (p38-regulated/activated protein kinase or MK5). The p38alpha-PRAK complex is found in the nucleus, whereas the p38beta-PRAK complex is exclusively localized to the cytosol. By generating a series of chimeric and point mutants of p38alpha and p38beta, we found two amino acid residues (Asp(145) and Leu(156) in p38alpha, Gly(145) and Val(156) in p38beta) that determine the distinct subcellular locations of p38alpha-PRAK and p38beta-PRAK. The subcellular localization of MK2 (MAPK-activated protein kinase 2), another downstream kinase of p38, was regulated in the same manner as that of PRAK. We found that nuclear import, but not export, determines the subcellular localization of p38alpha-PRAK and p38beta-PRAK. The published structure of the p38alpha-MK2 complex suggests Leu(156) of p38alpha is involved in the interaction with the nuclear localization signal in PRAK. The difference at this residue between p38alpha and p38beta may affect the nuclear localization signal in PRAK differently, and thereby influence the import of the complexes. Asp(145) in p38alpha (or Gly(145) in p38beta) is located on a different surface patch, and further random mutagenesis revealed that mutation of Asp(145), Thr(123), and Gln(325), the residues that can directly interact with importin alpha as predicted by modeling, but not mutation of the other 7 amino acid residues that cannot reach importin alpha, re-locate p38alpha-PRAK to the cytosol, suggesting that interaction with import machinery is involved in determining the subcellular localization of the p38alpha-PRAK and p38beta-PRAK complexes. Last, we show that nuclear localization of PRAK is required for its role in inhibiting the proliferation of NIH3T3 cells. In conclusion, multiple determinants control the distinct subcellular localization of p38alpha-PRAK and p38beta-PRAK complexes, and the location of PRAK plays a role in its function.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,141
Score d'incertitude au seuil0,327

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,027
Tête enseignante GPT0,235
Écart entre enseignants0,208 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations34
Publié2008
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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