MétaCan
Menu
Retour à la cohorte
Enregistrement W1990068611 · doi:10.1016/j.ijid.2014.03.767

Controversial role of leishmania RNA virus as a determinant of pathogenicity in human leishmaniasis

2014· article· en· W1990068611 sur OpenAlexaff
Braulio M. Valencia, Marlene Jara, Vanessa Adaui, Mathilde Chantry, Milena Alba, Ana Pilar Ramos, Jorge Arévalo, Alejandro Llanos‐Cuentas, Andrea K. Boggild

Notice bibliographique

RevueInternational Journal of Infectious Diseases · 2014
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueResearch on Leishmaniasis Studies
Établissements canadiensToronto General HospitalUniversity Health Network
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésLeishmania braziliensisLeishmaniasisLeishmaniaVirologyCutaneous leishmaniasisBiologyRNAPolymerase chain reactionMolecular biologyGeneImmunologyGeneticsParasite hosting

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Background: American tegumentary leishmaniasis (ATL) is a neglected disease of South America where metastatic mucosal lesions (ML) can be seen in up to 5-20% of Leishmania Viannia complex infections. The Leishmania RNA virus-1 (LRV1) has been recently implicated as a possible pathogenic agent in ATL since disseminated disease (DisL) was induced by high LRV1-expressing amastigotes in an animal model, and human cases of DisL have been reportedly infected with LRV1-containing Leishmania parasites. None of these studies clearly supported its role in human disease. Methods & Materials: Fifty-six subjects with parasitologically confirmed ATL were clinically and parasitologically assessed. Lesion biopsy specimens were processed for detection and quantification of Leishmania (Viannia) DNA by a quantitative real-time PCR (qPCR) assay targeting kinetoplast DNA (kDNA) minicircles. Leishmania (Viannia) species were identified by PCR targeting the mpi gene and PCR-RFLP assays targeting cpb and hsp70 genes. LRV1 RNA detection was performed using reverse transcription (RT)-qPCR targeting conserved viral sequences. Results: Subjects were clinically classified as follows: a) Localized cutaneous leishmaniasis (LCL, 42.9%), b) ML (n = 28, 50%), and c) DisL (n = 4, 7.1%). Strain identification by clinical category was: a) LCL: L. (V.) braziliensis (56%) and L. (V.) guyanensis (31.3%), b) ML: L. (V.) braziliensis (60%) and L. (V.) peruviana (40%), and c) DisL: L. (V.) guyanensis. Rate of LRV1 detection was 7.1% in ML (2/28), 8.3% in LCL (2/24) and 50% in DisL (2/4). Considering DisL and ML as metastatic disease (MD) and LCL as non-metastatic disease (nMD), the rate of LRV1 detection was 8.3% in nMD and 12,5% in MD (p = 1.0). Even though detection of LRV1 was higher in DisL, an important co-morbidity was detected in those patients: HIV infection, subclinical TB infection, and disseminated mycobacterial disease. Parasite load in MD and nMD was comparable (37.8 vs. 86.4 parasites per 106 human cells, p = 0.52). There were no clinical or parasitological differences between parasite infected and non-infected by LRV1. Conclusion: Our findings do not resemble those reported in animal models. LRV1 may be a conditional contributor to metastatic spread of ATL, but we were unable to extrapolate findings from animal models to human disease.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,002
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,138
Score d'incertitude au seuil0,611

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,002
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0010,000
Bibliométrie0,0010,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,298
Écart entre enseignants0,290 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations10
Publié2014
Routes d'admission1
Résumé présentoui

Explorer davantage

Même revueInternational Journal of Infectious DiseasesMême sujetResearch on Leishmaniasis StudiesTravaux en français237 207