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Enregistrement W1990162155 · doi:10.1021/bi992564p

Identification of the Carbonic Anhydrase II Binding Site in the Cl<sup>-</sup>/HCO<sub>3</sub><sup>-</sup>Anion Exchanger AE1

2000· article· en· W1990162155 sur OpenAlexaff
John W. Vince, Reinhart A.F. Reithmeier

Notice bibliographique

RevueBiochemistry · 2000
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueIon channel regulation and function
Établissements canadiensUniversity of Toronto
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésCarbonic anhydrase IIChemistryBinding sitePeptide sequencePeptideBiochemistryMutantTitrationAmino acidCarbonic anhydraseEnzymeInorganic chemistryGene

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The human Cl(-)/HCO(3)(-) anion exchanger (AE1) possesses a binding site within its 33 residue carboxyl-terminal region (Ct) for carbonic anhydrase II (CAII). The amino acid sequence comprising this CAII binding site was determined by peptide competition and by testing the ability of truncation and point mutants of the Ct sequence to bind CAII with a sensitive microtiter plate binding assay. A synthetic peptide consisting of the entire 33 residues of the Ct (residues 879-911) could compete with a GST fusion protein of the Ct (GST-Ct) for binding to immobilized CAII, while a peptide consisting of the last 16 residues (896-911) could not. A series of truncation mutants of the GST-Ct showed that the terminal 21 residues of AE1 were not required for binding CAII. Removal of four additional residues (887-890) from the Ct resulted in loss of CAII binding. Acidic residues in this region (D887ADD) were critical for binding since mutating this sequence in the GST-Ct to DAAA, AAAA, or NANN caused loss of CAII binding. A GST-Ct construct mutated to D887ANE, the homologous sequence in AE2, could bind CAII. AE2 is a widely expressed anion exchanger and has a homologous Ct region with 60% sequence identity to AE1. A GST fusion protein of the 33 residue Ct of AE2 could bind to CAII similarly to the Ct of AE1. Tethering of CAII to an acidic motif within the Ct of anion exchangers may be a general mechanism for promoting bicarbonate transport across cell membranes.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,005

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,008
Tête enseignante GPT0,217
Écart entre enseignants0,209 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations173
Publié2000
Routes d'admission1
Résumé présentoui

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