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Enregistrement W1990193846 · doi:10.1074/jbc.m707736200

State-dependent Access of Anions to the Cystic Fibrosis Transmembrane Conductance Regulator Chloride Channel Pore

2008· article· en· W1990193846 sur OpenAlexafffundabout
Mohammad Fatehi, Paul Linsdell

Notice bibliographique

RevueJournal of Biological Chemistry · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueCystic Fibrosis Research Advances
Établissements canadiensDalhousie University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health Research
Mots-clésChemistryChloride channelCystic fibrosis transmembrane conductance regulatorBiophysicsExtracellularCysteineIon channelConductanceIntracellularPatch clampMembrane potentialTransmembrane proteinBiochemistryBiologyEnzyme

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The cystic fibrosis transmembrane conductance regulator (CFTR) Cl(-) channel is gated by intracellular factors; however, conformational changes in the channel pore associated with channel activation have not been identified. We have used patch clamp recording to investigate the state-dependent accessibility of substituted cysteine residues in the CFTR channel pore to a range of cysteine-reactive reagents applied to the extracellular side of the membrane. Using functional modification of the channel current-voltage relationship as a marker of modification, we find that several positively charged reagents are able to penetrate deeply into the pore from the outside irrespective of whether or not the channels have been activated. In contrast, access of three anionic cysteine-reactive reagents, the methanesulfonate sodium (2-sulfonatoethyl)methanesulfonate, the organic mercurial p-chloromercuriphenylsulfonic acid, and the permeant anion Au(CN)(2)(-), to several different sites in the pore is strictly limited prior to channel activation. This suggests that in nonactivated channels some ion selectivity mechanism exists to exclude anions yet permit cations into the channel pore from the extracellular solution. We suggest that activation of CFTR channels involves a conformational change in the pore that removes a strong selectivity against anion entry from the extracellular solution. We propose further that this conformational change occurs in advance of channel opening, suggesting that multiple distinct closed pore conformations exist.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,001
Score d'incertitude au seuil0,004

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0010,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,049
Tête enseignante GPT0,321
Écart entre enseignants0,272 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations26
Publié2008
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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