Genetic diversity analyses of <i>Brassica napus</i> accessions using SRAP molecular markers
Pourquoi ce travail est dans la base
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Notice bibliographique
Résumé
Knowledge about genetic diversity among Brassica napus cultivars developed for many growing regions and their possible use as potential inbred lines for hybrid seed production is limited. We studied the genetic diversity and relationships among B. napus accessions using Sequence Related Amplified Polymorphism (SRAP) markers, which preferentially amplify open reading frames. A total of 60 spring-type B. napus accessions were screened using 20 SRAP primers, which revealed 162 polymorphic fragments with an average of eight markers per primer combination. Genetic similarity estimates ranged from 40 to 100, which indicated sufficient diversity among the accessions. The majority of the accessions were uniquely identified by the markers with the exception of near-isogenic inbred lines. Cluster analysis displayed five major groups. The first major cluster comprised 23 accessions mostly of Australian origin, whereas the second cluster included 13 accessions mostly of Canadian origin. The accessions in the first and second clusters were identified as maintainers of cytoplasmic male sterility. The two restorer lines R-111 and R-101 along with their corresponding backcross progeny constituted the third cluster. Scandinavian cultivars made the fourth separate cluster. One cultivar Salam and its respective inbred line were the most divergent lines. Variations in the number of markers between open-pollinated cultivars and their respective selfed inbred lines were also observed. The clustering pattern mostly supported their respective pedigree and characteristic traits. Genetic diversity in genetically distinct groups in the tested maintainer and restorer lines can be exploited for hybrid development in B. napus .
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Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,000 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle