First Report of <i>Blueberry scorch virus</i> in Black Huckleberry in British Columbia
Notice bibliographique
Résumé
Blueberry scorch virus (BlScV), an aphid-borne carlavirus, causes a serious disease of highbush blueberry (Vaccinium corymbosum L.) in North America and Europe. Symptoms of BlScV infection on highbush blueberry include necrosis of flower blossoms and young leaves, shoot blight, and chlorosis. Currently, cranberry (Vaccinium macrocarpon L.) is the only other natural host of BlScV. In July 2004, wild black huckleberry (Vaccinium membranaceumL.) was sampled in the Kootenay Region of southeastern British Columbia. Foliar tissues were sampled during 2004 from 11 bushes from a clearing on the side of a mountain near Crawford Bay, BC, Canada and tested by double-antibody sandwich-ELISA using polyclonal antiserum (Agdia Inc., Elkhart, IN). BlScV was detected in 6 of the 11 bushes sampled and in the positive control (BlScV-infected blueberry leaf tissue) and was not detected in the negative control (healthy blueberry leaf tissue). To confirm the presence of the virus, total nucleic acid was extracted from ELISA-positive huckleberry samples according to an established protocol (A. Rowhani et al. Proc. Int. Counc. Stud. Viruses Virus-Like Dis. Grapevine, Extended Abstr. 13:148, 2000). Reverse transcription-PCR was performed using pd(T)12-18 random primer (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) for reverse transcription and BlScV-specific primers developed against the published NJ-2 sequence of BlScV (GenBank Accession No. NC_003499). Using the forward primer, BS708F, (5′-TCAATCCGTGGTGCTACGAG-3′), and the reverse primer, BS1188R, (5′-ACAGTGCGCAATGTTCCAGT-3′), a 480-bp amplicon was obtained from each of the ELISA-positive samples, while no ampli-cons were observed for the negative control (ELISA-negative huckleberry tissue). Direct sequencing of one selected amplicon revealed 90, 84, and 77% nucleotide sequence identity and 97, 96, and 88% amino acid sequence identity with strains NJ-2, BC-1 (GenBank Accession No. AY941198) and BC-2 (GenBank Accession Nos. AY941199), respectively. BlScV-infected huckleberries were asymptomatic. The presence of BlScV in alternate hosts has implications for disease epidemiology. Testing for BlScV in Vaccinium species in and around commercial highbush blueberry plantings, as well as lowbush blueberry (V. angustifolium Aiton), rabbiteye blueberry (V. ashei Reade), other native Pacific Northwest species (V. ovatum Pursh and V. parvifolium Smith), and ornamental Vaccinium species is warranted. To our knowledge, this is the first report of BlScV infecting black huckleberry.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,003 | 0,000 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,001 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,001 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,003 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».