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Enregistrement W1990209240 · doi:10.1094/pdis-91-3-0328c

First Report of <i>Blueberry scorch virus</i> in Black Huckleberry in British Columbia

2007· article· en· W1990209240 sur OpenAlexaffabout
L. A. Wegener, Zamir K. Punja, Robert R. Martín

Notice bibliographique

RevuePlant Disease · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Virus Research Studies
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésBiologyVacciniumHorticultureBotanyPlant virusVirusVirology

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Blueberry scorch virus (BlScV), an aphid-borne carlavirus, causes a serious disease of highbush blueberry (Vaccinium corymbosum L.) in North America and Europe. Symptoms of BlScV infection on highbush blueberry include necrosis of flower blossoms and young leaves, shoot blight, and chlorosis. Currently, cranberry (Vaccinium macrocarpon L.) is the only other natural host of BlScV. In July 2004, wild black huckleberry (Vaccinium membranaceumL.) was sampled in the Kootenay Region of southeastern British Columbia. Foliar tissues were sampled during 2004 from 11 bushes from a clearing on the side of a mountain near Crawford Bay, BC, Canada and tested by double-antibody sandwich-ELISA using polyclonal antiserum (Agdia Inc., Elkhart, IN). BlScV was detected in 6 of the 11 bushes sampled and in the positive control (BlScV-infected blueberry leaf tissue) and was not detected in the negative control (healthy blueberry leaf tissue). To confirm the presence of the virus, total nucleic acid was extracted from ELISA-positive huckleberry samples according to an established protocol (A. Rowhani et al. Proc. Int. Counc. Stud. Viruses Virus-Like Dis. Grapevine, Extended Abstr. 13:148, 2000). Reverse transcription-PCR was performed using pd(T)12-18 random primer (Amersham Biosciences, Piscataway, NJ) for reverse transcription and BlScV-specific primers developed against the published NJ-2 sequence of BlScV (GenBank Accession No. NC_003499). Using the forward primer, BS708F, (5′-TCAATCCGTGGTGCTACGAG-3′), and the reverse primer, BS1188R, (5′-ACAGTGCGCAATGTTCCAGT-3′), a 480-bp amplicon was obtained from each of the ELISA-positive samples, while no ampli-cons were observed for the negative control (ELISA-negative huckleberry tissue). Direct sequencing of one selected amplicon revealed 90, 84, and 77% nucleotide sequence identity and 97, 96, and 88% amino acid sequence identity with strains NJ-2, BC-1 (GenBank Accession No. AY941198) and BC-2 (GenBank Accession Nos. AY941199), respectively. BlScV-infected huckleberries were asymptomatic. The presence of BlScV in alternate hosts has implications for disease epidemiology. Testing for BlScV in Vaccinium species in and around commercial highbush blueberry plantings, as well as lowbush blueberry (V. angustifolium Aiton), rabbiteye blueberry (V. ashei Reade), other native Pacific Northwest species (V. ovatum Pursh and V. parvifolium Smith), and ornamental Vaccinium species is warranted. To our knowledge, this is the first report of BlScV infecting black huckleberry.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Étude de cas · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,214
Score d'incertitude au seuil0,431

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,001
Études des sciences et des technologies0,0030,000
Communication savante0,0010,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0010,001
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0030,001

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,242
Écart entre enseignants0,220 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeÉtude de cas
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations5
Publié2007
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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