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Enregistrement W1990228223 · doi:10.1126/scisignal.137pl2

Analysis of Signaling Events by Combining High-Throughput Screening Technology with Computer-Based Image Analysis

2008· article· en· W1990228223 sur OpenAlex

Pourquoi ce travail est dans la base

Une base qui oublie comment elle a trouvé un travail ne peut pas être vérifiée. Voici les voies qui ont admis celui-ci.

affAu moins un auteur déclare une institution canadienne dans l'instantané OpenAlex épinglé.

Notice bibliographique

RevueScience Signaling · 2008
Typearticle
Langueen
DomaineBiochemistry, Genetics and Molecular Biology
ThématiqueUbiquitin and proteasome pathways
Établissements canadiensMcGill University
Organismes subventionnairesnon disponible
Mots-clésThroughputComputer scienceComputational biologyHigh-content screeningBioinformaticsBiologyGeneticsTelecommunicationsCellWireless

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

Intracellular signaling and cell-to-cell communication depend on the coordination of numerous signaling events, and this large flow of information has to be properly organized in space and time. Common and critical to all of these processes and the ultimate cellular response is the correct spatial distribution of signaling components and their targets. This fundamental concept applies to a large number of signaling processes. It is frequently important to quantify the localization of signaling molecules within different cellular compartments to detect subtle changes or to define threshold levels of signaling molecules in a certain location that are necessary to trigger subsequent events. Of particular importance is the separation of nuclear and cytoplasmic events, and sensitive methods are required to measure their contribution to signal transduction. Procedures described here allow the quantification of fluorescence signals located in the nucleus, cytoplasm, or at the nuclear envelope. The methods rely on high-throughput imaging equipment, confocal microscopy, and software modules that measure the fluorescence intensity in the compartment of interest. We discuss the rationale for selecting the appropriate equipment for image acquisition and the proper software modules to quantify fluorescence in distinct cellular compartments. Initially, high-throughput technology for high-speed image acquisition was developed for multiwell plates. We adapted high-throughput technology for image acquisition for cells grown on cover slips. Images of higher spatial resolution along the z axis were acquired by confocal microscopy. For subsequent analyses, the choice of appropriate software modules is critical for rapid and reliable quantification of fluorescence intensities.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,001
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,270
Score d'incertitude au seuil0,846

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0010,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0010,007
Études des sciences et des technologies0,0000,001
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0010,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,012
Tête enseignante GPT0,247
Écart entre enseignants0,234 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle