Relating RNA:DNA ratio in Eurytemora affinis to seston fatty acids in a highly dynamic environment
Notice bibliographique
Résumé
MEPS Marine Ecology Progress Series Contact the journal Facebook Twitter RSS Mailing List Subscribe to our mailing list via Mailchimp HomeLatest VolumeAbout the JournalEditorsTheme Sections MEPS 400:143-154 (2010) - DOI: https://doi.org/10.3354/meps08413 Relating RNA:DNA ratio in Eurytemora affinis to seston fatty acids in a highly dynamic environment Julien Pommier, Jean-Jacques Frenette*, Hélène Glémet Groupe de Recherche sur les Écosystèmes Aquatiques (GREA), Université du Québec à Trois-Rivières (UQTR), Département de Chimie-Biologie, 3351, boul. des Forges, Trois-Rivières (QC) G9A 5H7, Canada *Corresponding author. Email: jean-jacques.frenette@uqtr.ca ABSTRACT: Nine stations were sampled across the St. Lawrence estuarine transition zone (ETZ) in summer 2006 in order to investigate the variability in Eurytemora affinis growth condition, as revealed by RNA:DNA ratios, and its relationship to the nutritional quality of seston, expressed in terms of fatty acid (FA) composition. The population of E. affinis in the St. Lawrence ETZ was under the influence of brackish waters, as well as fresh and saline waters landwards and seawards of the frontal mixing zone, respectively. The RNA:DNA ratio for E. affinis throughout the ETZ ranged from 2.14 to 23.01, with an average value of 10.30 ± 4.35. When compared with the previously reported RNA:DNA ratio for copepods under optimal growth conditions, our values suggest that the summertime population of E. affinis in the St. Lawrence ETZ was in good growth condition. The hydrodynamic imprint within the St. Lawrence ETZ translated into the distribution pattern of seston having various FA compositions. Freshwater seston was of better nutritional quality (i.e. richer in essential fatty acids) than that from brackish and more saline waters. However, this did not translate into a significantly different E. affinis RNA:DNA ratio between the 3 types of waters. Yet, the growth condition of E. affinis under the influence of fairly stable fresh waters was associated with the relative abundance of 20:5n3-rich seston advected from upstream despite the low contribution of chl a to total suspended particulate matter. Moreover, a comparison between seston and zooplankton FA composition revealed the potential trophic transfer of diatom-related FA from producers to consumers within fresh waters. No such correlations were evidenced within the most dynamic parts of the ETZ (brackish and more saline waters) where the relationship between E. affinis growth condition and seston quality was likely constrained by a spatial-temporal decoupling between seston and zooplankton. KEY WORDS: Eurytemora affinis · RNA:DNA ratio · Fatty acids · Estuarine transition zone · St. Lawrence River Full text in pdf format PreviousNextCite this article as: Pommier J, Frenette JJ, Glémet H (2010) Relating RNA:DNA ratio in Eurytemora affinis to seston fatty acids in a highly dynamic environment. Mar Ecol Prog Ser 400:143-154. https://doi.org/10.3354/meps08413 Export citation RSS - Facebook - Tweet - linkedIn Cited by Published in MEPS Vol. 400. Online publication date: February 11, 2010 Print ISSN: 0171-8630; Online ISSN: 1616-1599 Copyright © 2010 Inter-Research.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction distillée sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.
Scores Codex et Gemma par catégorie
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,001 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,004 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».