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Enregistrement W1990442073 · doi:10.1186/1750-1172-7-22

Capturing phenotypic heterogeneity in MPS I: results of an international consensus procedure

2012· article· en· W1990442073 sur OpenAlexafffund
Minke H. de Ru, Q. Teunissen, Johanna H. van der Lee, Michael Beck, Olaf A. Bodamer, L. Clarke, Carla E. M. Hollak, Shuan-Pei Lin, Gregory M. Pastores, Julian Raiman, Maurizio Scarpa, Eileen P. Treacy, Anna Tylki‐Szymańska, J. E. Wraith, J Zeman, Frits A. Wijburg

Notice bibliographique

RevueOrphanet Journal of Rare Diseases · 2012
Typearticle
Langueen
DomaineMedicine
ThématiqueLysosomal Storage Disorders Research
Établissements canadiensSickKids FoundationHospital for Sick ChildrenUniversity of TorontoUniversity of British Columbia
Organismes subventionnaireslékařská fakulta Univerzity KarlovySchool of Medicine, New York UniversityMackay Memorial HospitalUniversity of TorontoSanofi GenzymeUniversità degli Studi di PadovaHospital for Sick ChildrenYork UniversityUniverzita Karlova v Praze
Mots-clésMucopolysaccharidosis type IMucopolysaccharidosis IEnzyme replacement therapyPhenotypeMedicineMucopolysaccharidosisGenetic heterogeneityInternal medicineGeneticsBiologyDisease

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

BACKGROUND: Mucopolysaccharidosis type I (MPS I) is traditionally divided into three phenotypes: the severe Hurler (MPS I-H) phenotype, the intermediate Hurler-Scheie (MPS I-H/S) phenotype and the attenuated Scheie (MPS I-S) phenotype. However, there are no clear criteria for delineating the different phenotypes. Because decisions about optimal treatment (enzyme replacement therapy or hematopoietic stem cell transplantation) need to be made quickly and depend on the presumed phenotype, an assessment of phenotypic severity should be performed soon after diagnosis. Therefore, a numerical severity scale for classifying different MPS I phenotypes at diagnosis based on clinical signs and symptoms was developed. METHODS: A consensus procedure based on a combined modified Delphi method and a nominal group technique was undertaken. It consisted of two written rounds and a face-to-face meeting. Sixteen MPS I experts participated in the process. The main goal was to identify the most important indicators of phenotypic severity and include these in a numerical severity scale. The correlation between the median subjective expert MPS I rating and the scores derived from this severity scale was used as an indicator of validity. RESULTS: Full consensus was reached on six key clinical items for assessing severity: age of onset of signs and symptoms, developmental delay, joint stiffness/arthropathy/contractures, kyphosis, cardiomyopathy and large head/frontal bossing. Due to the remarkably large variability in the expert MPS I assessments, however, a reliable numerical scale could not be constructed. Because of this variability, such a scale would always result in patients whose calculated severity score differed unacceptably from the median expert severity score, which was considered to be the 'gold standard'. CONCLUSIONS: Although consensus was reached on the six key items for assessing phenotypic severity in MPS I, expert opinion on phenotypic severity at diagnosis proved to be highly variable. This subjectivity emphasizes the need for validated biomarkers and improved genotype-phenotype correlations that can be incorporated into phenotypic severity assessments at diagnosis.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,001
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Observationnel · Signal consensuel: Observationnel
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,006
Score d'incertitude au seuil0,406

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,001
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,029
Tête enseignante GPT0,320
Écart entre enseignants0,291 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeObservationnel
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations33
Publié2012
Routes d'admission2
Résumé présentoui

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