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Enregistrement W1990461099 · doi:10.1080/07060660709507465

Heterologous expression and activity of Ptr ToxB from virulent and avirulent isolates of<i>Pyrenophora tritici-repentis</i>

2007· article· en· W1990461099 sur OpenAlexafffundvenue
Yong Min Kim, Stephen E. Strelkov

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Plant Pathology · 2007
Typearticle
Langueen
DomaineAgricultural and Biological Sciences
ThématiquePlant Disease Resistance and Genetics
Établissements canadiensUniversity of Alberta
Organismes subventionnairesNatural Sciences and Engineering Research Council of Canada
Mots-clésPyrenophoraChlorosisBiologyToxinVirulenceGeneMicrobiologyGeneticsBotany

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The fungal pathogen Pyrenophora tritici-repentis causes tan spot, an important foliar disease of wheat (Triticum aestivum). The fungus produces at least three host-specific toxins, including the chlorosis-inducing Ptr ToxB, a small protein encoded by the ToxB gene. A ToxB homolog is also found in race 4 isolates of P. tritici-repentis, which lack detectable toxin activity. It is not clear whether the absence of toxin activity in these isolates stems from differences in the ToxB gene sequence and (or) level of expression. To directly compare the chlorosis-inducing activity of different forms of Ptr ToxB, ToxB from a virulent race 5 isolate (Alg3-24) and a ToxB homolog from an avirulent race 4 isolate (90-2) were heterologously expressed as glutathione-S-transferase (GST)- and hexahistidine (His)-tagged fusion proteins in Escherichia coli. Infiltration of toxin solutions into the leaves of Ptr ToxB sensitive and insensitive wheat seedlings revealed that the overexpressed GST- and His-tagged toxin from Alg3-24 induced strong chlorosis symptoms in a genotype-specific manner, whereas the form of the toxin from isolate 90-2 induced only trace amounts of symptoms. This suggests that the absence of chlorosis-inducing activity in race 4 of P. tritici-repentis may be largely due to sequence differences in ToxB at the gene and protein level, regardless of the extent of gene expression.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction distillée sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Apprise à partir de 10 348 étiquettes directes de Codex et de 10 348 étiquettes directes de Gemma. Le mode candidate est l'union des têtes enseignantes seuillées; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont ni des étiquettes humaines ni des étiquettes directes de modèles de pointe.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: codex-gemma-dda1882f352aStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: aucune
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,843
Score d'incertitude au seuil0,989

Scores Codex et Gemma par catégorie

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,011
Tête enseignante GPT0,196
Écart entre enseignants0,185 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule tête enseignante, pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations31
Publié2007
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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