Heterologous expression and activity of Ptr ToxB from virulent and avirulent isolates of<i>Pyrenophora tritici-repentis</i>
Notice bibliographique
Résumé
The fungal pathogen Pyrenophora tritici-repentis causes tan spot, an important foliar disease of wheat (Triticum aestivum). The fungus produces at least three host-specific toxins, including the chlorosis-inducing Ptr ToxB, a small protein encoded by the ToxB gene. A ToxB homolog is also found in race 4 isolates of P. tritici-repentis, which lack detectable toxin activity. It is not clear whether the absence of toxin activity in these isolates stems from differences in the ToxB gene sequence and (or) level of expression. To directly compare the chlorosis-inducing activity of different forms of Ptr ToxB, ToxB from a virulent race 5 isolate (Alg3-24) and a ToxB homolog from an avirulent race 4 isolate (90-2) were heterologously expressed as glutathione-S-transferase (GST)- and hexahistidine (His)-tagged fusion proteins in Escherichia coli. Infiltration of toxin solutions into the leaves of Ptr ToxB sensitive and insensitive wheat seedlings revealed that the overexpressed GST- and His-tagged toxin from Alg3-24 induced strong chlorosis symptoms in a genotype-specific manner, whereas the form of the toxin from isolate 90-2 induced only trace amounts of symptoms. This suggests that the absence of chlorosis-inducing activity in race 4 of P. tritici-repentis may be largely due to sequence differences in ToxB at the gene and protein level, regardless of the extent of gene expression.
Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.
Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».