Sexing Frogs by Real-Time PCR: Using Aromatase <b><i>(cyp19) </i></b>as an Early Ovarian Differentiation Marker
Notice bibliographique
Résumé
Most anurans have no identified sex-markers; therefore, alternative methods for identification of early changes in sex ratios are required. In this study, Lithobates sylvaticus and Silurana tropicalis tadpoles were sampled at different developmental stages covering the entire process of sex differentiation. Three candidate genes known to be involved in sex differentiation in other vertebrate species were selected to develop a method to identify phenotypic sex in frogs: cytochrome p450 aromatase (cyp19), forkhead box L2 (foxl2) and the cytochrome 17-alpha-hydroxylase/17,20 lyase (cyp17). Cloning of these genes revealed nucleotide identity values ranging between 75-97% when compared to other amphibian species. Gene expression of cyp17,cyp19 and foxl2 in L. sylvaticus adult gonads and gonad-mesonephros complex (GMC) of tadpoles was analyzed by real-time RT-PCR. Results showed clear sexually dimorphic patterns in the expression of the 3 genes. Our analysis reveals that GMC gene expression levels of cyp19 alone can be used as a robust predictor of phenotypic sex in L. sylvaticus tadpoles. In addition, we validated this method measuring cyp19 mRNA levels in S. tropicalis GMCs. We propose measuring cyp19 as a tool to study the effects of chemical contaminants (including endocrine disrupting compounds) on amphibian gonadal development and sex ratios in the future.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,001 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,001 |
| Bibliométrie | 0,001 | 0,001 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,001 |
| Communication savante | 0,001 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,001 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,001 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».