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Enregistrement W1990651326 · doi:10.1139/w09-001

Generation and characterization of the antibacterial activity of a novel hybrid antimicrobial peptide comprising functional domains from different insect cecropins

2009· article· en· W1990651326 sur OpenAlexafffundvenue
Richard M. Plunkett, Stuart I. Murray, Carl Lowenberger

Notice bibliographique

RevueCanadian Journal of Microbiology · 2009
Typearticle
Langueen
DomaineImmunology and Microbiology
ThématiqueAntimicrobial Peptides and Activities
Établissements canadiensSimon Fraser University
Organismes subventionnairesCanadian Institutes of Health ResearchNatural Sciences and Engineering Research Council of CanadaCanada Research ChairsMichael Smith Health Research BC
Mots-clésCecropinAntimicrobial peptidesPeptideAntibacterial activityBiologyHemolysisAntimicrobialBiochemistryInnate immune systemDefensinBiological activityDrosophila melanogasterBacteriaMicrobiologyIn vitroImmunologyGeneGenetics

Résumé

récupéré en direct d'OpenAlex

The search for new antimicrobial compounds involves finding novel sources of chemotherapeutic compounds or manipulating and combining structures from existing molecules. Small antimicrobial peptides (AMPs) are components of innate immune defenses characterized in greatest detail in insect-derived AMPs. We have generated hybrid AMPs (hAMPs) by combining functional motifs from different insect AMPs as a proof of principle that we can generate molecules with lower minimum inhibitory concentrations, and with different activity and target specificity than either parent molecule. A two-helix, cecropin-like hAMP was created by linking the N-terminal alpha helix of cecropin A from Aedes aegypti to the C-terminal alpha helix of cecropin A1 from Drosophila melanogaster. This molecule exhibits antibacterial activity at sub-micromolar concentrations with a target specificity that differs from either parent molecule. Antibacterial activity of the hybrid molecule was found to be greater against Gram-negative than Gram-positive bacteria. No hemolysis was observed in sheep red blood cells exposed to concentrations up to 50 micromol/L, suggesting the peptide is not detrimental to eukaryotic cells.

Récupéré en direct depuis OpenAlex et désinversé. Les résumés ne sont pas conservés dans cette base de données : les index inversés représentent 8,6 Go des 9,3 Go de texte de la base, et le serveur dispose de 13 Go libres.

Comment cette classification a été obtenuedéplier

Prédiction machine sur la base complète

Imitation des enseignants

Ni prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.

score de la tête « metaresearch » (Codex)0,000
score de la tête « metaresearch » (Gemma)0,000
Version: metacan-v3-hybrid-931329e0061cStatut de validation: machine_predicted_unvalidated
Catégories candidatesaucune
Catégories consensuellesaucune
DomaineSignal candidat: aucune · Signal consensuel: aucune
Devis d'étudeSignal candidat: Expérimental (laboratoire) · Signal consensuel: Expérimental (laboratoire)
GenreSignal candidat: Empirique · Signal consensuel: Empirique
Score de désaccord entre enseignants0,000
Score d'incertitude au seuil0,001

Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)

CatégorieCodexGemma
Métarecherche0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens strict)0,0000,000
Méta-épidémiologie (sens large)0,0000,000
Bibliométrie0,0000,000
Études des sciences et des technologies0,0000,000
Communication savante0,0000,000
Science ouverte0,0000,000
Intégrité de la recherche0,0000,000
Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger)0,0000,000

Scores machine (provisoires)

Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.

Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.

Tête enseignante Opus0,023
Tête enseignante GPT0,199
Écart entre enseignants0,176 · la distance entre les deux têtes enseignantes sur ce seul travail
Statut de validationscore_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découle

Classification

machine, non validée

Prédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.

Les modèles n’ont appliqué aucune catégorie : rien dans la taxonomie ne correspondait à ce travail.
Devis d'étudeExpérimental (laboratoire)
Domainenon disponible
GenreEmpirique

Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».

En bref

Citations8
Publié2009
Routes d'admission3
Résumé présentoui

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