Analysis of Ion Interactions with the K+ -dependent Na+/Ca+ Exchangers NCKX2, NCKX3, and NCKX4
Notice bibliographique
Résumé
K(+)-dependent Na(+)/Ca(2+) exchangers (NCKX) catalyze cytosolic Ca(2+) extrusion and are particularly important for neuronal Ca(2+) signaling. Of the five mammalian isoforms, the detailed functional characteristics have only been reported for NCKX1 and -2. In the current study, the functional characteristics of recombinant NCKX3 and -4 expressed in HEK293 cells were determined and compared with those of NCKX2. Although the apparent affinities of the three isoforms for Ca(2+) and Na(+) were similar, NCKX3 and -4 displayed approximately 40-fold higher affinities for K(+) ions than NCKX2. Functional analysis of various NCKX2 mutants revealed that mutation of Thr-551 to Ala, the corresponding residue in NCKX4, resulted in an apparent K(+) affinity shift to one similar to that of NCKX4 without a parallel shift in apparent Ca(2+) affinity. In the converse situation, when Gln-476 of NCKX4 was converted to Lys, the corresponding residue in NCKX2, both the K(+) and Ca(2+) affinities were reduced. These results indicate that the apparently low K(+) affinity of NCKX2 requires a Thr residue at position 551 that may reduce the conformational flexibility and/or K(+) liganding strength of side-chain moieties on critical neighboring residues. This interaction appears to be specific to the structural context of the NCKX2 K(+) binding pocket, because it was not possible to recreate the K(+)-specific low affinity phenotype with reciprocal mutations in NCKX4. The results of this study provide important information about the structure and function of NCKX proteins and will be critical to understanding their roles in neuronal Ca(2+) signaling.
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Comment cette classification a été obtenuedéplier
Prédiction machine sur la base complète
Imitation des enseignantsNi prévalence calibrée, ni vérité terrain. Validation humaine à venir. Le volet Gemma est une étiquette directe du modèle pour chaque travail de la base, lue sur la notice réduite au titre. Le volet Codex est un classifieur appris des 10 348 étiquettes directes de Codex et calibré sur les taux pondérés de l'échantillon; les champs sans appui suffisant ne portent aucun appel Codex. Le mode candidate est l'union des deux volets; le consensus est leur intersection. Ces sorties portent le statut machine_predicted_unvalidated et ne sont pas des étiquettes humaines.
Scores du classifieur distillé par catégorie (deux têtes)
| Catégorie | Codex | Gemma |
|---|---|---|
| Métarecherche | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens strict) | 0,000 | 0,000 |
| Méta-épidémiologie (sens large) | 0,000 | 0,000 |
| Bibliométrie | 0,000 | 0,000 |
| Études des sciences et des technologies | 0,000 | 0,000 |
| Communication savante | 0,000 | 0,000 |
| Science ouverte | 0,000 | 0,000 |
| Intégrité de la recherche | 0,000 | 0,000 |
| Charge utile insuffisante (le modèle a refusé de juger) | 0,001 | 0,000 |
Scores machine (provisoires)
Les deux têtes enseignantes du modèle étudiant, lues sur ce travail. Un score ordonne la base pour la relecture; il n'affirme jamais une catégorie, et le statut de validation accompagne chaque rangée tel quel.
Scores de référence d'un modèle non mature (critères de maturité non atteints, 7 itérations). Un score ordonne; il n'affirme jamais une catégorie.
score_only:v0-immature-baseline · tel quel depuis la passe de notation : score_only signifie que le nombre peut ordonner les travaux, et qu'aucune étiquette de catégorie n'en découleClassification
machine, non validéePrédiction automatique; un appel candidat d’une seule source (Gemma direct ou Codex distillé), pas un consensus.
Le détail, modèle par modèle et score par score, se trouve en fin de page sous « Comment cette classification a été obtenue ».